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L'analyse génétique révèle des différences dans le choix du partenaire entre le saumon coho sauvage et le saumon d'écloserie :


Une nouvelle étude des profils génétiques du saumon coho sauvage et d’élevage démontre des distinctions importantes dans la façon dont les deux forms de poissons forment des couples d’accouplement.

Ces découvertes des chercheurs de l’Oregon Condition College fournissent de nouvelles informations sur les différences subtiles entre les poissons sauvages et les poissons d’écloserie qui pourraient entraîner des changements dans la façon dont les poissons d’écloserie sont accouplés pour favoriser le succès des poissons d’écloserie et conserver et protéger les poissons sauvages.

“Les gènes peuvent nous donner un aperçu que nous ne pourrions pas percevoir en utilisant la perception sensorielle humaine. Je peux voir des différences de taille et de couleur, mais les gènes nous donnent des informations sur des choses que nous ne pouvons pas voir, entendre ou ressentir”, a déclaré Heather Auld, une article- associé de recherche doctoral à la station d’expérimentation maritime côtière de l’Oregon de l’Oregon Point out University et auteur principal de l’étude.



“Si nous pouvons en savoir in addition sur la façon dont les poissons d’origine naturelle s’accouplent dans la character, et si cela diffère de la façon dont les poissons d’écloserie s’accouplent dans la character, nous pouvons potentiellement recueillir de nouvelles informations pour améliorer les stratégies d’accouplement appliquées dans les écloseries.”

Les résultats des chercheurs ont été publiés récemment dans la revue Integrative Organismal Biology.



Le saumon coho sauvage est répertorié comme menacé en vertu de la loi américaine sur les espèces en voie de disparition dans une grande partie de son aire de répartition, y compris le prolonged de la côte de l’Oregon et du cours inférieur du fleuve Columbia, en raison de la surpêche, de la pollution, d’autres pertes associées à leur habitat d’eau douce et des mauvaises conditions océaniques liées au changement climatique..

Les attempts déployés il y a 40 ans pour renforcer l’abondance se sont fortement concentrés sur la creation de poissons d’écloserie, mais le saumon sauvage s’est avéré meilleur en termes de replica que ceux des écloseries. Les chercheurs ont également découvert que les poissons issus des écloseries peuvent avoir un affect négatif sur les poissons sauvages et leur capacité à se reproduire.

« Il a été démontré pour quatre espèces de saumon que les poissons d’écloserie qui se reproduisent dans la mother nature ne sont pas aussi viables que les poissons sauvages. Et s’ils se reproduisent avec des poissons sauvages, il y a un risque de réduction du nombre de descendants qui résultent des poissons sauvages. a déclaré le co-auteur Michael Banks, professeur de génomique des pêches, de conservation et de comportement au département des sciences de la pêche, de la faune et de la conservation de l’OSU et à la station d’expérimentation marine côtière de l’Oregon au Hatfield Marine Science Centre de l’OSU. “Ce que nous essayons de trouver maintenant, c’est un moyen de fabriquer un meilleur poisson d’écloserie qui n’ait pas d’impact sur le rabattement des poissons sauvages.”

À l’aide de matériel génétique collecté à partir de clips de nageoires, les chercheurs ont effectué un séquençage du génotype, où le génome entier d’un poisson est scanné pour des marquages ​​spécifiques et analysé pour révéler les profils génétiques de centaines de poissons sauvages et d’écloserie.

Ils ont découvert que les poissons d’écloserie et les poissons sauvages ont tendance à présenter un assortiment négatif, ce qui signifie qu’ils recherchent des partenaires génétiquement différents d’eux. L’assortiment négatif est une constatation courante dans l’accouplement, motor vehicle l’accouplement pour la différence est un moyen d’améliorer la résistance aux maladies, a déclaré Financial institutions.

Mais les chercheurs ont découvert que les poissons d’écloserie et les poissons sauvages présentent un assortiment négatif à différents marqueurs génétiques. Et bien que les chercheurs aient identifié ces différences, ils ne savent toujours pas grand-chose sur bon nombre de ces gènes associés à un assortiment négatif.

“Nous ne savons pas quels sont les résultats de ces gènes”, a déclaré Auld. “Nous savons que certains peuvent être liés au développement neuronal, et certains peuvent être liés au comportement, mais nous ne savons pas exactement comment leurs caractéristiques spécifiques se présentent chez le poisson.”

À l’aide des informations de cette étude et de travaux antérieurs, les chercheurs tentent maintenant de mieux imiter l’accouplement naturel du saumon coho dans un environnement d’écloserie. Travaillant à partir de l’écloserie de Sandy sur Cedar Creek, un affluent de la rivière Sandy de l’Oregon, les chercheurs collectent des échantillons de tissus de poissons qui sont revenus frayer, puis tentent de trouver des correspondances génétiques similaires à celles trouvées chez les poissons sauvages.

Pour chaque femelle, ils divisent les œufs en deux tons. La moitié des œufs sont fécondés avec un mâle sélectionné au hasard, comme c’est typique pour la pratique des couvoirs  l’autre moitié est fécondée avec un “meilleur” mâle sélectionné sur la foundation des informations de profil génétique observées lors de l’accouplement de poissons sauvages dans un contexte naturel.

“Nous faisons une ponte dirigée où nous essayons d’imiter la nature”, a déclaré Banking companies. “Ce n’est pas un straightforward exploit automobile nous avons observé dans la nature que la plupart des gènes sont associés au choix d’un partenaire différent, mais certains gènes sont également associés au choix de quelque chose de similaire. en tant que stratégies assorties au sein des mêmes décisions d’accouplement.”

Les chercheurs ont travaillé avec Dana Gibbon, une analyste bioinformatique du Center for Quantitative Daily life Sciences, pour développer un nouvel algorithme informatique, appelé MultiFaceted Option, afin de fournir les meilleurs choix parmi les mâles et les femelles arrivant sur la desk de ponte.

Les chercheurs retourneront bientôt à l’écloserie pour s’accoupler à nouveau pour la troisième année de l’expérience de trois ans. C’est également la première année où ils s’attendent à rencontrer les premiers carangues ou jeunes saumons mâles qui reviennent dès la première année de leur expérience.

“Certains des vérins commenceront à revenir cette année, et nous prévoyons que tous les retours de l’automne prochain jusqu’en 2025 proviendront de notre expérience”, a déclaré Auld. “Nous continuerons à prélever des échantillons génétiques tout au extensive de cette période pour déterminer si ce processus a réussi.

“Selon ce que nous trouvons, cela pourrait potentiellement modifier la façon dont nous accouplons les poissons d’écloserie. Et cela peut entraîner des poissons d’écloserie qui ressemblent davantage à des poissons sauvages et ont moins d’impact sur les poissons sauvages.”

Les co-auteurs de l’étude sont le directeur de laboratoire David Jacobson du Département des pêches, de la faune et de la conservation de l’OSU et de la station d’expérimentation maritime côtière de l’Oregon au Hatfield Marine Science Middle de l’OSU et Adelaide Rhodes, auparavant au Centre des sciences de la vie quantitatives de l’OSU et travaillant maintenant aux Countrywide Institutes of Wellness.

La recherche a été financée par un prix de l’Oregon Hatchery Analysis Centre Fund administré par le ministère de la Pêche et de la Faune de l’Oregon.