En période d’exacerbation de la perte de biodiversité, des données fiables sur l’occurrence des espèces sont essentielles pour que des actions de conservation rapides et adéquates soient lancées. Cela est particulièrement vrai pour les écosystèmes d’eau douce, qui sont particulièrement vulnérables et menacés par les impacts anthropiques. Leur état écologique a déjà été mis en avant comme une priorité absolue par de multiples directives nationales et internationales, comme la directive-cadre européenne sur l’eau.



Cependant, les méthodes de surveillance traditionnelles, telles que la pêche électrique, les méthodes de piégeage ou les évaluations basées sur l’observation, qui constituent le statu quo actuel en matière de surveillance des poissons, sont souvent chronophages et coûteuses. En conséquence, au cours de la dernière décennie, les scientifiques ont progressivement convenu que nous avions besoin d’une méthode in addition complète et holistique pour évaluer la biodiversité des eaux douces.

Pendant ce temps, des études récentes ont continuellement démontré que les analyses de codage à barres eDNA, où les traces d’ADN trouvées dans l’eau sont utilisées pour identifier les organismes qui y vivent, est une méthode efficace pour capturer la biodiversité aquatique d’une manière rapide, fiable, non invasive et relativement faible. manière de coût. Dans de telles études de méta-codage à barres, les scientifiques échantillonnent, collectent et séquencent l’ADN, afin de pouvoir le comparer avec les bases de données existantes et identifier les organismes sources.



De furthermore, comme les évaluations de méta-codage à barres eDNA utilisent des échantillons d’eau, souvent des cours d’eau, situés au issue le moreover bas, un tel échantillon contient généralement non seulement des traces de spécimens qui entrent en call immediate avec l’eau, par exemple en nageant ou en buvant, mais collecte également des traces des espèces terrestres indirectement by way of les précipitations, la fonte des neiges, les eaux souterraines, etc.

Dans les évaluations regular du méta-codage eDNA des poissons, ces  » données de prises accessoires  » sont généralement laissées de côté. Pourtant, dans une standpoint de suivi as well as holistique de la biodiversité, ils recèlent un potentiel huge pour détecter également la présence d’espèces terrestres et semi-terrestres dans le bassin versant.

Dans leur nouvelle étude, publiée dans la revue scientifique en libre accès Metabarcoding and Metagenomics, des chercheurs allemands de l’Université de Duisburg-Essen et de l’Agence allemande pour l’environnement ont détecté avec succès une quantité étonnante de mammifères et d’oiseaux locaux originaires de l’État de Saxe-Anhalt en collectant jusqu’à 18 litres d’eau sur un tronçon de deux kilomètres le long de la rivière Mulde.

En fait, il n’a fallu qu’une journée à l’équipe, dirigée par Till-Hendrik Macher, doctorant dans le projet GeDNA financé par l’Agence fédérale allemande pour l’environnement, pour collecter les échantillons. En utilisant le méta-codage à barres pour analyser l’ADN des échantillons, les chercheurs ont identifié jusqu’à 50 % des poissons, 22 % des espèces de mammifères et 7,4 % des espèces d’oiseaux nicheurs de la région.

Cependant, l’équipe a également conclu que bien qu’il ne faudrait normalement que 10 litres d’eau pour évaluer la faune aquatique et semi-terrestre, les espèces terrestres nécessitaient un échantillonnage beaucoup additionally essential.

Le déverrouillage des données à partir des informations de additionally en as well as disponibles sur le méta-codage eDNA des poissons permet des synergies entre les programmes de surveillance de la biodiversité terrestre et aquatique, ajoutant d’autres informations importantes sur la diversité des espèces dans l’espace et dans le temps.

« Nous encourageons donc à exploiter les données de surveillance de la biodiversité du méta-codage eDNA des poissons pour informer d’autres programmes de conservation », a déclaré l’auteur principal de Until-Hendrik Macher.

« Pour cela, cependant, il est essentiel que les données eDNA soient stockées conjointement et accessibles pour différentes campagnes de surveillance et d’évaluation de la biodiversité, que ce soit au niveau étatique, fédéral ou international », conclut Florian Leese, qui coordonne le projet.