Le chemin qu’emprunte une cellule d’un most cancers sain à un cancer métastatique est principalement déterminé par des changements épigénétiques, selon une nouvelle étude informatique. Le Dr Eduard Porta, chef du groupe d’immunogénomique du cancer à l’Institut de recherche sur la leucémie Josep Carreras, a participé à la nouvelle analyse récemment publiée dans la revue Character.
Chaque cellule fabrique ses propres protéines en accédant aux informations génétiques contenues dans ses gènes. Les modifications de ces informations, appelées mutations, peuvent ruiner la fonction des protéines affectées. En oncologie, cela est considéré comme la génétique du most cancers. Les dernières décennies ont cependant vu l’émergence d’un nouveau domaine : l’épigénétique du cancer.
Il existe un vaste programme épigénétique contrôlant ainsi le fonctionnement général de la cellule et, lorsqu’il est altéré, il peut la placer au départ d’une transformation maligne. Existe-t-il un moyen de suivre ces changements et de comprendre l’épigénétique de la changeover vers le cancer ?
Une équipe internationale de chercheurs a commencé à franchir cette étape tant attendue. Dans un tour de power, ils ont analysé 1,7 million de cellules provenant de 225 échantillons d’origine primaire et métastatique, provenant de 205 individuals de 11 forms de most cancers différents. Pour chaque cellule, l’équipe a obtenu le transcriptome complet, l’exome et l’épigénome. Cela couvre pratiquement toutes les mutations génétiques, l’accessibilité des gènes et leurs conséquences. Grâce à une grande puissance de calcul, ils ont pu déduire l’état fonctionnel complet de chaque cellule analysée et le relier à son kind de most cancers particulier.
Les résultats des travaux, publiés dans la revue scientifique Mother nature, démontrent que de nombreuses régions de l’ADN sont activées ou inactivées de manière différentielle de manière spécifique au cancer, créant ainsi une signature pour chaque tumeur. Ces différences sont pertinentes pour la progression du most cancers et nombre d’entre elles correspondent à des caractéristiques du cancer déjà identifiées, c’est-à-dire aux étapes qu’une cellule doit suivre pour devenir maligne. Le Dr Eduard Porta, chef de groupe à l’Institut de recherche sur la leucémie Josep Carreras (IJC-CERCA), fait partie de l’équipe et a contribué avec son expérience dans l’analyse de grandes quantités de données biologiques.
Les changements épigénétiques au niveau de l’ADN apparaissent comme une cause sous-jacente du cancer, selon la nouvelle publication. En particulier, l’accessibilité des régions amplificatrices, une sorte de régulateur principal agissant sur plusieurs gènes à la fois. Pris ensemble, les résultats convergent vers une courte liste de gènes pouvant être utilisés comme marqueurs de bon ou de mauvais pronostic, informations précieuses pour la gestion clinique des sufferers.
L’analyse a également permis d’identifier les voies cellulaires de ces gènes importants, permettant ainsi de suivre leurs interactions à distance. Parfois, les gènes affectés sont si fondamentaux qu’il est unattainable de les traiter directement sans effets secondaires. Mais, connaissant le cheminement complet, les chercheurs peuvent développer des stratégies pour cibler le maillon le moreover faible de la chaîne, maximisant ainsi les bénéfices thérapeutiques tout en minimisant les effets indésirables.
