Xavier Boyer
Des chercheurs de l’Institut des sciences et technologies d’Okinawa (OIST) ont mis au issue une méthode pour mesurer la biodiversité des coraux en extrayant l’ADN environnemental (ou eDNA) d’un litre d’eau de mer de surface area prélevé au-dessus d’un récif. Il a été confirmé que la méthode fonctionne grâce aux observations faites par des plongeurs scientifiques dans les mêmes zones océaniques. La recherche, menée en collaboration avec le Centre des sciences environnementales de la préfecture d’Okinawa et l’Université de Tokyo, a été publiée dans les Actes de la Royal Modern society B : Organic Sciences. Cela a ouvert la voie à des enquêtes complètes à grande échelle sur les coraux constructeurs de récifs et supprime la dépendance aux observations directes effectuées par le biais de la plongée sous-maritime scientifique ou de la plongée en apnée.
“Les magnifiques récifs coralliens des mers subtropicales et tropicales ne représentent que, 2 % de l’ensemble de l’océan”, a déclaré le co-auteur, le professeur Nori Satoh, chercheur principal de l’unité de génomique maritime de l’OIST. “Cependant, ce sont les zones les plus riches en biodiversité des océans, qui abritent environ 30% de toute la vie maritime. Les coraux constructeurs de récifs jouent un rôle clé dans la création de récifs coralliens, mais le récent réchauffement climatique et d’autres facteurs ont provoqué le blanchissement, et de nombreux coraux les récifs sont en hazard de disparition.”
Pour conserver et protéger les récifs coralliens, il est important de savoir d’abord quel corail existe sur le récif et remark la composition d’un récif évolue au fil du temps. Auparavant, la seule façon d’étudier efficacement un récif était de faire appel à des plongeurs et des plongeurs qui observaient directement le corail et enregistraient les espèces et les changements au fil du temps. Cela prenait du temps, était coûteux et demandait beaucoup de primary-d’œuvre. Mais les chercheurs utilisent maintenant l’ADN que les créatures vivantes libèrent dans l’environnement, à travers la peau, les déchets et le mucus. En extrayant cet eDNA de l’eau de mer et en l’analysant, une image claire des organismes qui habitent cette partie de l’océan peut être trouvée, sans jamais avoir à entrer dans l’eau.
Les coraux constructeurs de récifs, ou durs, sont des éléments vitaux des récifs coralliens. On estime qu’il existe approximativement 1 300 espèces de coraux constructeurs de récifs dans 236 genres dans le monde. Ces coraux libèrent du mucus dans l’eau de mer environnante, qui contient une partie de l’ADN. En 2021, des chercheurs de l’OIST et de l’Université de Tokyo ont réussi à développer des outils qui amplifient et identifient l’ADN de 45 genres de coraux constructeurs de récifs.
Maintenant, les chercheurs ont testé si ces outils sont efficaces et précis en menant une étude à grande échelle de l’océan entourant Okinawa en utilisant à la fois la méthode eDNA et des plongeurs scientifiques. Cela impliquait une observation visuelle directe par deux plongeurs pour identifier les genres coralliens dominants et la collecte de deux ou trois bouteilles d’un litre d’eau de mer de surface sur chaque web page. L’eau de mer a été filtrée dès que achievable pour fixer l’ADN environnemental piégé dans les filtres et les filtres ont été ramenés au laboratoire de l’OIST pour analyse. Sur une période de quatre mois, de début septembre à fin décembre 2021, 62 web pages autour de l’île principale d’Okinawa ont été étudiés et deux à quatre genres de coraux dominants sur chaque récif ont été enregistrés.
“Nous avons constaté que l’analyse de l’eDNA correspondait à celle des observations scientifiques directes avec une précision de furthermore de 91 %”, a déclaré le chercheur scientifique de l’OIST, le Dr Koki Nishitsuji, leading auteur de l’article. “En fait, 41 des 62 internet sites étaient identiques. La méthode eDNA a indiqué la présence de cinq genres coralliens dominants sur les 62 sites étudiés. De furthermore, les résultats de la méthode ADN environnementale suggèrent la présence de coraux jamais enregistrés le long de la côte. d’Okinawa.”
La méthode eDNA nécessite des informations de séquençage complexes, et pour cette raison, seuls 45 des 236 genres estimés peuvent actuellement être détectés. Avec plus d’informations, l’efficacité de la méthode eDNA augmentera. Et, bien que des recherches supplémentaires soient nécessaires, la méthode eDNA peut être en mesure d’indiquer la présence de coraux difficiles à détecter par observation directe.
