Fournir un choc électrique mineur dans un ruisseau pour révéler tout poisson qui se cache à proximité peut être la norme d’or pour détecter les populations de poissons, mais ce n’est pas très amusant pour la truite.



Des scientifiques de l’Université d’État de l’Oregon ont découvert que l’échantillonnage de l’eau des cours d’eau pour détecter la présence de diverses espèces à l’aide de l’ADN environnemental, connu sous le nom d’ADN électronique, peut être furthermore précis que la pêche électrique, sans perturber le poisson.

« Cela révolutionne la façon dont nous travaillons sur l’écologie des poissons », a déclaré Brooke Penaluna, biologiste de recherche auprès du département américain de l’Agriculture et du Service des forêts, également nommée au Département des pêches et de la faune de l’OSU. « Vous pouvez identifier les espèces à partir d’une bouteille d’eau à l’aide d’outils génétiques. Lorsque vous allez sur le web site, je peux vous dire ce qu’il y a dans ce ruisseau juste en fonction de ce qu’il y a dans cette bouteille d’eau. »



Penaluna est l’auteur principal d’une étude publiée mercredi dans Ecosphere qui a comparé l’efficacité de l’échantillonnage d’ADN électronique et de la pêche électrique pour détecter à quelle length en amont la truite fardée côtière était présente dans les ruisseaux côtiers et Cascade de Washington et de l’Oregon.

Déterminer à quelle length les poissons sont présents en amont est important pour guider les pratiques de gestion forestière, auto les cours d’eau contenant des poissons reçoivent as well as de protections que les cours d’eau sans poisson. Il contribue également à informer la conservation en améliorant la compréhension des scientifiques de la distribution et des mouvements d’espèces spécifiques.

La pêche électrique est la méthode typical pour surveiller la répartition des poissons dans les designs d’eau depuis les années 1960. Il s’agit de coller deux électrodes dans l’eau et d’appliquer un courant continu, ce qui affecte les poissons qui nagent à proximité et les fait nager vers l’une des électrodes. La personne qui effectue le prélèvement peut ensuite ramasser les poissons étourdis dans un filet et collecter des données avant de les remettre à l’eau, où ils reprennent une activité normale en quelques minutes.

L’échantillonnage de recherche pour l’ADNe est utilisé depuis plus d’une décennie mais n’est pas encore largement utilisé dans l’industrie ou la gestion des ressources. Il s’agit de collecter des échantillons d’eau sur area et d’effectuer des checks en laboratoire pour vérifier la présence d’ADN pour certaines espèces de poissons, que les poissons perdent régulièrement par excrétion et modifications de leur peau ou de leur mucus.

L’étude OSU a testé l’efficacité de l’eDNA pour trouver le position « dernier poisson », les poissons les moreover éloignés en amont sont présents. Les chercheurs ont recherché la truite fardée côtière, car or truck c’est le poisson le moreover souvent trouvé en amont dans les ruisseaux du côté ouest du Pacifique Nord-Ouest, en raison de son cycle de vie et de sa taille.

Les chercheurs ont choisi 60 ruisseaux côtiers de l’Oregon et de Washington et ont effectué un échantillonnage d’ADN électronique et une pêche électrique tous les 50 mètres jusqu’à 250 mètres en amont du dernier point de « dernier poisson » enregistré pour chaque cours d’eau.

Ils ont constaté que dans les cours d’eau où la pêche à l’électricité ne détectait aucune truite, il y avait encore 40% de odds que l’échantillonnage d’ADN e montre des preuves de leur présence. La détection de l’ADNe a révélé des poissons moreover en amont que la pêche électrique dans 31 cours d’eau, dans certains cas jusqu’à 250 mètres au-dessus de l’endroit où la pêche électrique a identifié le « dernier poisson ».

Cependant, les deux méthodes peinaient encore à détecter la truite lorsque les poissons étaient à faible densité.

Les chercheurs ont déterminé que l’ADNe est un complément utile à la pêche électrique, en particulier dans les endroits où les débris ou la végétation rendent la pêche électrique not possible, mais ce n’est pas un remplacement complet. La détection de l’ADN électronique est moins perturbatrice pour les poissons et nécessite moins de permis pour les chercheurs, mais la pêche électrique offre aux chercheurs la possibilité d’enregistrer d’autres données physiques sur le poisson, y compris la taille, la santé et l’apparence, que la détection d’ADN électronique ne permet pas.

« Nous essayons de faire valoir que nous ne visons pas à éliminer la pêche électrique, mais simplement que nous pouvons l’utiliser comme un complément à cela, pour fournir moreover d’informations rapidement et proprement », a déclaré Ivan Arismendi, co-auteur de l’étude. et professeur adjoint au Département des pêches et de la faune de l’OSU.

« Vous pouvez utiliser l’un et l’autre comme un outil de confirmation – donc si vous avez une dilemma sur les espèces en voie de disparition, vous pouvez utiliser les deux, et vous pouvez être moreover robuste sur la présence si les deux méthodes sont d’accord. »

Les chercheurs espèrent que la détection d’eDNA deviendra in addition populaire, automobile le coût et le temps requis pour exécuter les tests d’eDNA continuent de baisser et l’équipement sur le terrain devient additionally facilement disponible. La détection d’eDNA dans un ruisseau à proximité serait même achievable d’utiliser pour un projet scolaire, a déclaré Penaluna.

« Je pense qu’il y a une utilisation très massive pour cela », a-t-elle déclaré. « Maintenant, je pense que les prochaines étapes sont pour les gestionnaires et les décideurs politiques de commencer à dessiner certaines de ces lignes directrices. »

L’étude était un exemple de science de la coproduction où les propriétaires fonciers fédéraux, étatiques et privés travaillaient avec des chercheurs. Penaluna a collaboré avec les chercheurs de l’OSU Arismendi, Jennifer Allen, Taal Levi et Tiffany Garcia et Jason Walter du Weyerhaeuser Centralia Research Centre à Washington.