Alors que le COVID-19 balaie le monde, des virus apparentés circulent tranquillement parmi les animaux sauvages. Une nouvelle étude montre remark le SRAS-CoV-2, le virus qui lead to le COVID-19, et le SRAS-CoV-1, qui a causé l’épidémie de SRAS de 2003, sont liés les uns aux autres. Les travaux, publiés récemment dans la revue Virus Evolution, aident les scientifiques à mieux comprendre l’évolution de ces virus, remark ils ont acquis la capacité d’infecter les humains et quels autres virus peuvent être prêts pour des retombées humaines.



« Remark ces virus sont-ils devenus ce qu’ils sont aujourd’hui ? Pourquoi certains d’entre eux ont-ils la capacité d’infecter les humains alors que d’autres ne le font pas ? » a déclaré Simon Anthony, professeur agrégé de pathologie, de microbiologie et d’immunologie à l’École de médecine vétérinaire de l’Université de Californie, Davis, et auteur principal de l’article.

Comprendre l'évolution des virus de variety SRAS et COVID-19

Le SRAS-CoV-1 et le SRAS-CoV-2 appartiennent à un groupe appelé les sarbécovirus, a déclaré Anthony, mais ils sont en fait assez différents les uns des autres. Les scientifiques ont divisé les sarbécovirus en cinq lignées, le SRAS-CoV-1 appartenant à la lignée 1 et le SRAS-CoV-2 à la lignée 5.



Même si ces deux virus appartiennent à des lignées différentes, ils pénètrent tous les deux dans les cellules humaines en utilisant le récepteur ACE2.

« C’est frappant », a déclaré Anthony, « car il existe d’autres virus additionally étroitement liés au SRAS-CoV-1 qui n’utilisent pas ACE2. Alors, remark le SRAS-CoV-1 a-t-il fini par avoir des similitudes avec un virus in addition éloigné ?  »

Un arbre généalogique de virus

Anthony et Heather Wells, un étudiant diplômé de l’Université de Columbia, ont construit un arbre généalogique de tous les virus de form SRAS. Ils ont découvert que la lignée 5 – qui contient le SRAS-CoV-2 – est la lignée ancestrale. Ils ont conclu que la plupart des virus de la lignée 1 liés au SRAS-CoV-1 avaient depuis longtemps perdu la capacité d’utiliser les récepteurs ACE2 humains en raison de délétions dans leur génome. Mais le SRAS-CoV-1 et quelques autres virus ont retrouvé la capacité d’utiliser l’ACE2 humaine à un moment donné.

Cela s’est probablement produit grâce à un processus appelé recombinaison, a déclaré Wells. Pour que cela se produise, deux virus différents doivent avoir infecté le même animal en même temps, produisant un virus hybride capable d’infecter les humains by way of ACE2.

L’arbre généalogique donne également un aperçu des origines géographiques de ces virus, a déclaré Wells. Jusqu’à présent, tous les virus utilisant ACE2 ont été détectés dans la province du Yunnan, ce qui implique que le SRAS-CoV-2 n’est pas originaire de Wuhan, où les premiers cas de COVID-19 ont été signalés, mais ailleurs en Chine.

Une problem sans réponse est: pourquoi le SRAS-CoV-2 est-il apparu maintenant ? Si ce virus a toujours ciblé ACE2, il a peut-être longtemps eu la capacité d’infecter les humains. Alors, qu’est-ce qui l’a incité à émerger à ce second-là ?

« Il doit y avoir d’autres facteurs impliqués », a déclaré Anthony. « Avoir la capacité génétique d’infecter les humains n’est qu’une partie de l’histoire. »

Cette étude fournit un contexte évolutif expliquant pourquoi ces virus se comportent comme ils le font, a déclaré Anthony. Il permet aux chercheurs de placer les virus récemment découverts dans l’arbre généalogique et d’estimer s’ils ont le potentiel d’infecter les humains.

« Nous savons maintenant que le fait d’avoir le potentiel génétique de débordement ne signifie pas que cela se produira – mais il est essential d’identifier les virus à haut risque. Nous pouvons ensuite utiliser des études épidémiologiques ou écologiques pour déterminer remark et si les personnes entrent en call. avec des chauves-souris ou d’autres animaux porteurs de ces virus « , a déclaré Anthony.

« C’est aussi un joli rappel qu’il existe de nombreux virus que nous devons mieux comprendre – SARS-CoV-1 et 2 ne seront pas les seuls », a-t-il déclaré.

Les autres co-auteurs de l’étude sont: Tracy Goldstein, Christine Kreuder Johnson, Jonna Mazet, Michael Cranfield et Kirsten Gilardi, Just one Well being Institute et Karen C. Drayer Wildlife Overall health Middle, UC Davis Faculty of Veterinary Medicine Benard Ssebide et Julius Nziza, Gorilla Medical practitioners and Mountain Gorilla Veterinary Undertaking Vincent Munster, Université de l’État de Washington, Pullman, Washington Michael Letko et Maria Diuk-Wasser, Laboratoire de virologie, Institut national des allergic reactions et des maladies infectieuses, NIH, Hamilton, Montana Gorka Lasso, Collège de médecine Albert Einstein, New York Denis Byarugaba, Université Makerere, Kampala, Ouganda Isamara Navarrete-Macias et Eliza Liang, Université de Columbia Barbara Han, Cary Institute of Ecosystem Scientific studies, Millbrook, New York et Morgan Tingley, UCLA.

Le travail a été soutenu par des subventions du NIH et de l’USAID via le projet Predict.