Pour l’éradication de l’infection par le VIH-1, il est crucial d’élucider les caractéristiques détaillées et l’hétérogénéité des cellules infectées par le VIH-1 in vivo. Dans cette étude, un modèle de souris humanisé transplanté de cellules souches hématopoïétiques infectées par un VIH-1 modifié par un gène a été utilisé pour révéler de multiples caractéristiques de cellules productrices de VIH-1 in vivo.



Un groupe de recherche de l’Institut des sciences médicales de l’Université de Tokyo (IMSUT) utilisant des cellules infectées par le VIH-1 a effectué des analyses « multiomiques », systems récemment développées pour étudier de manière exhaustive les caractéristiques des échantillons biologiques.

« Nos résultats décrivent de multiples caractéristiques des cellules productrices de VIH-1 in vivo, qui pourraient fournir des indices pour le développement d’un remède contre le VIH-1. », A déclaré le scientifique principal, Kei Sato, professeur agrégé (chercheur principal) à la Division de Virologie des systèmes, Département de contrôle des maladies infectieuses, IMSUT.



Les résultats de cette recherche ont été publiés dans Cell Stories le 14 juillet 2020.

Étude pour « guérir le VIH-1 »

Pour l’éradication de l’infection par le VIH-1, il est vital d’acquérir une compréhension approfondie des caractéristiques étendues des cellules infectées par le VIH-1 in vivo.

Les analyses « omiques » récemment développées (* 1) peuvent être un outil puissant pour identifier les caractéristiques des cellules infectées par le VIH-1. Cependant, il convient de noter qu’une grande majorité des cellules T CD4 + (* 2) chez les individus infectés ne sont pas infectées et que, par conséquent, les profils transcriptionnels des cellules T CD4 + « en vrac » in vivo ne reflètent pas ceux du VIH « pur ». 1 cellules productrices.

Analyse multiomique pour révéler de manière exhaustive les caractéristiques des cellules infectées par le VIH-1 in vivo

Dans cette étude, le groupe de recherche a utilisé un modèle de souris humanisé transplanté de cellules souches hématopoïétiques humaines qui maintient la leucopoïèse humaine dans des problems immunologiques relativement stables in vivo et un reporter compétent pour la réplication du VIH-1, et a utilisé quatre procedures récemment développées pour étudier la génomique virale et transcriptomique.

Selon le groupe de recherche, cette étude se composait des quatre analyses suivantes:

Premièrement, la PCR numérique par gouttelettes a révélé la présence de réservoirs potentiels chez des souris humanisées infectées. Deuxièmement, la PCR médiée par ligature a montré la préférence du VIH-1 pour s’intégrer dans les régions de chromatine ouvertes, comme suggéré par l’association des modifications épigénétiques des websites d’intégration avec la production virale. Troisièmement, le séquençage numérique de l’ARN a quantifié le nombre absolu de copies de transcrits viraux dans les cellules productrices de VIH-1 in vivo et a en outre identifié les gènes différentiellement exprimés entre les cellules infectées par le virus et non infectées. Enfin, le séquençage d’ARN monocellulaire a révélé et caractérisé l’hétérogénéité des cellules productrices de VIH-1 in vivo.

Le professeur agrégé Sato a souligné: « À notre connaissance, cette étude est la première enquête à décrire de multiples facets des cellules productrices de VIH-1 et aussi la première enquête complète sur les caractéristiques des cellules infectées par le VIH-1 in vivo ».

Remarques (* 1) analyses ‘omiques’

Un domaine d’étude scientifique qui vise à caractériser et quantifier de manière exhaustive la caractéristique des échantillons biologiques. La combinaison de plusieurs catégories d’informations biologiques « -ome » (par exemple, génome et transcriptome).

(* 2) Cellules T CD4 +

Un sous-ensemble de cellules immunitaires qui orchestre la réponse immunitaire acquise.

Le financement

Cette étude a été soutenue en partie par AMED J-Pleasure (19fm0208006h0003 à Kei Sato), KAKENHI Scientific Investigate B (18H02662 à Kei Sato), KAKENHI Scientific Investigation on Revolutionary Areas « Neovirology » (16H06429, 16K21723, 17H05813, 19H04826 to Kei Sato), JST CREST (à Kei Sato), JSPS KAKENHI PAGS 16H06279 (à K.Sato), Programme de recherche AMED sur le VIH / SIDA 19fk0410014 (19fk0410014, 19fk0410019 à Yoshio Koyanagi et Kei Sato), et JSPS Study Fellow (à 19Jei Ito17) ).