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Une étude de preuve de concept est prometteuse pour un système d'apprentissage automatique qui utilise des données de santé électroniques pour faire ses prédictions

Des chercheurs de Johns Hopkins Medication et de l’Université Johns Hopkins ont créé et testé de manière préliminaire ce qu’ils pensent être l’un des premiers modèles pour prédire qui a la plus forte probabilité d’être résistant au COVID-19 malgré l’exposition au SRAS-CoV-2, le virus qui le lead to.

L’étude est publiée en ligne aujourd’hui dans la revue PLOS 1.

déclare l’auteure principale de l’étude, Karen (Kai-Wen) Yang, étudiante diplômée en génie biomédical au laboratoire de recherche et d’innovation en informatique translationnelle de l’Université Johns Hopkins. “Cette idée pourrait conduire à de nouvelles mesures préventives et à des traitements moreover ciblés.”

Pour son étude. Ces personnes, dit Yang, pourraient alors être étudiées pour mieux comprendre les facteurs favorisant leur résistance.

comme le cerveau.

déclare le co-auteur principal de l’étude, Stuart Ray, MD, vice-président de la médecine pour l’intégrité et l’analyse des données, et professeur de médecine à la Johns Hopkins University University of Drugs. “Sur la base de leur succès.”

Le registre contient des informations sur les clients vus au sein du système de santé Johns Hopkins qui ont été suspectés ou confirmés comme ayant une an infection par le SRAS-CoV-2.

Pour leur étude de résistance, les chercheurs n’ont inclus que les personnes qui ont reçu un take a look at COVID-19 entre le 10 juin 2020 et le 15 décembre 2020 et qui ont signalé une «exposition potentielle au virus» comme raison du test.

La day de fin était le moment où les endeavours de vaccination à grande échelle contre le COVID-19 ont commencé aux États-Unis. Le choix de cette date, disent les chercheurs, leur a permis d’éviter les effets sur leurs découvertes des vaccins prévenant l’infection plutôt que la résistance naturelle.

Les 8 536 participants à l’étude qui ont déclaré l’exposition comme raison pour se faire tester COVID ont été divisés en deux groupes  :, dont au moins une était un affected individual COVID-19. Le leading groupe, avec 8 476 des members, a été désigné comme l’ensemble de development et de examination, tandis que le next groupe. comptait 60 membres et a été utilisé comme un ensemble de exam distinct.

Maintenir le nombre de ménages à 10 ou moins, selon les chercheurs. des dortoirs et d’autres zones de vie à plusieurs unités à furthermore forte densité où l’exposition à une personne particulière positive pour le SRAS-CoV-2 serait moins rigorous.

Pour identifier les modèles et les members au cluster afin que ceux qui sont naturellement résistants au SRAS-CoV-2 se démarquent, les deux ensembles d’études ont été analysés à l’aide de l’algorithme MASPC (Maximal-frequent All-confident sample Range Pattern-dependent Clustering). sexe et race), les codes de diagnostic médical de la Classification statistique internationale des maladies et des problèmes de santé connexes (CIM) pertinents pour chaque cas, les commandes de médicaments ambulatoires et le nombre des comorbidités (autres maladies) présentes.

“Nous avons émis l’hypothèse que MASPC nous permettrait de regrouper les people présentant des schémas similaires dans leurs données pour les définir comme résistants et non résistants au SRAS-CoV-2. déclare Ray. “Cette étude initiale utilisant les données de JH-CROWN a été menée pour donner vie à cette hypothèse.”

“Dans l’ensemble de formation et de test, nous avons identifié 56 modèles de codes ICD divisés en deux groupes  : associés à la résistance ou non associés”, explique Yang. »

“En recherchant ces modèles dans l’ensemble HHI – les individus les plus susceptibles d’avoir été exposés au SRAS-CoV-2 de près – puis en analysant statistiquement les résultats, la meilleure performance de notre modèle était de, 61”, explique Ray. « Puisqu’un score de, 5 ne montre qu’une association fortuite entre la prédiction et la réalité, et 1 est une association à 100 %, cela montre que le modèle est prometteur en tant qu’outil pour identifier les personnes résistantes au COVID-19 qui peuvent être étudiées in addition avant », déclare Ray.

Les limites de l’étude, dit Ray, incluent le biais potentiel de l’auto-déclaration de l’exposition au COVID-19 par les members, le petit nombre de individuals dans le groupe HHI, la possibilité que les members testent le SRAS-CoV-2 à l’aide de kits à domicile ou dans des établissements en dehors du système Johns Hopkins (et par conséquent, les checks n’ont pas été enregistrés dans la foundation de données JH-CROWN), et la courte durée de l’étude elle-même.

Avec Yang et Ray, les membres de l’équipe d’étude de Johns Hopkins Medicine et de l’Université Johns Hopkins sont les étudiants diplômés et de leading cycle Yijia Chen, Jacob Desman, Kevin Gorman, Chloé Paris, Ilia Rattsev, Tony Wei et Rebecca Yoo et les co-auteurs principaux de la faculté Joseph Greenstein et Casey Overby Taylor.

Les auteurs de l’étude ne signalent aucun conflit d’intérêts.