En octobre 2020, le SRAS-CoV-2 est à l'origine d'une pandémie go on, avec additionally de 35 tens of millions de cas signalés et in addition d'un million de décès dans le monde. Une caractéristique importante qui distingue le COVID-19 du SRAS en termes de réponses immunitaires est la faible induction d'une réponse à l'interféron de type I (IFN) par le SRAS-CoV-2 par rapport au SRAS-CoV et au virus de la grippe A. Notamment, des réponses IFN altérées sont associées à la maladie COVID-19. Cependant, les mécanismes moléculaires qui sous-tendent les réponses IFN inefficaces dans l'infection par le SRAS-CoV-2 restent incertains.




Une équipe de recherche de l'Institut des sciences médicales de l'Université de Tokyo (IMSUT) a cherché à caractériser le (s) facteur (s) viral (s) déterminant l'activation immunitaire lors d'une infection par le SRAS-CoV-2 et a découvert que l'ORF3b, un gène codé par le SRAS-CoV-2, est un puissant antagoniste de l'IFN.

Identification d'un facteur viral qui altère les réponses immunitaires chez les sufferers COVID-19

« Les mauvaises réponses IFN chez les people COVID-19 peuvent être expliquées par l'action de ce produit viral, ORF3b », a déclaré le scientifique principal, Kei Sato, professeur agrégé (chercheur principal) à la Division de la virologie des systèmes, Département de contrôle des maladies infectieuses, IMSUT.




Les résultats de cette recherche ont été publiés dans « Cell Stories » le 4 septembre 2020.

ORF3b comme antagoniste viral de l’IFN

Bien que l'infection par le SRAS-CoV provoque une pneumonie aiguë et sévère, l'infection par le SRAS-CoV-2 peut être asymptomatique ou entraîner des symptômes pseudo-grippaux tels que fièvre, toux et exhaustion. De additionally, par rapport aux infections par le SRAS-CoV et la grippe A, une caractéristique de l'infection par le SRAS-CoV-2, COVID-19, est la faible induction d'un interféron de sort I (IFN). Notamment, les réponses IFN altérées sont associées à la gravité du COVID-19. Cependant, les mécanismes moléculaires sous-jacents aux réponses IFN inefficaces dans l'infection par le SRAS-CoV-2 restent flous.

En comparant les séquences des gènes codant pour le SARS-CoV-2 à celles du SARS-CoV, le groupe de recherche a constaté que la longueur du gène du SARS-CoV-2 ORF3b est nettement furthermore courte que celle du SARS-CoV ORF3b.

Parce que l'ORF3b du SRAS-CoV est connu comme un antagoniste viral contre la manufacturing d'IFN, ils ont émis l'hypothèse que la différence sur la longueur du gène ORF3b entre le SRAS-CoV-2 et le SRAS-CoV peut modifier leur activité anti-IFN et peut en outre expliquer la différence dans les symptômes de ces deux infections virales.

De manière surprenante, le SARS-CoV-2 ORF3b est un antagoniste de l'IFN in addition puissant que le SARS-CoV ORF3b. Des analyses phylogénétiques et des tests fonctionnels ont révélé que les virus associés au SRAS-CoV-2 provenant de chauves-souris et de pangolins codent également pour des produits géniques ORF3b moreover courts avec une forte activité anti-IFN.

Caractérisation d'un variant naturel du SRAS-CoV-2 ORF3b avec une activité anti-IFN renforcée

En outre, des analyses d'environ 17 000 séquences de SRAS-CoV-2 ont identifié un variant naturel, dans lequel un cadre de lecture ORF3b plus lengthy a été reconstitué. Cette variante supprime l'IFN encore as well as efficacement que l'ORF3b de la souche parentale SARS-CoV-2.

En accord avec une affiliation de suppression de l'IFN avec la gravité de la maladie, les deux sufferers en Equateur porteurs du SRAS-CoV-2 avec le variant ORF3b étendu étaient gravement malades l'un a été traité dans une unité de soins intensifs et l'autre est décédé du COVID-19.

Fait essential, cependant, il n'y a aucune preuve directe indiquant que les virus détectés chez ces deux patients COVID-19 en Équateur sont moreover pathogènes que la souche de référence. Bien qu'ils ne puissent pas dire si cette variante est associée à un résultat différent dans la maladie, il est plausible que les variantes de longueur naturelles d'ORF3b puissent potentiellement contribuer à l'émergence de variantes plus pathogènes du SRAS-CoV-2.

Ainsi, il sera vital de continuer à surveiller les séquences virales pour voir si de nouveaux variants ORF3b émergent au cours de la pandémie actuelle.

Le professeur agrégé Kei Sato a déclaré que « À notre connaissance, cette étude est la première enquête révélant le rôle d'une protéine codée par le SRAS-CoV-2 qui peut être associée à la development du COVID-19. »