La nouvelle méthode utilise des approaches d’analyse d’images microscopiques pour mesurer automatiquement l’organisation du cytosquelette. Les chercheurs s’attendent à ce qu’il améliore considérablement notre compréhension de divers phénomènes cellulaires liés au regroupement du cytosquelette.



Le cytosquelette est une construction fibreuse à l’intérieur de la cellule constituée de protéines. Il forme des constructions d’ordre supérieur appelées réseaux et faisceaux qui maintiennent ou modifient la forme de la cellule en fonction de son état. Une compréhension précise des structures tissées par le cytosquelette permet d’estimer l’état d’une cellule. Dans le passé, l’analyse des constructions du cytosquelette d’ordre supérieur était généralement effectuée par observation visuelle du cytosquelette coloré au microscope par un specialist. Cependant, ces méthodes conventionnelles reposent sur le jugement subjectif du chercheur, et manquent donc d’objectivité. De moreover, à mesure que le nombre d’échantillons à analyser augmente, les frais de staff des industry experts augmentent également.

Pour contrer ces problèmes, le professeur associé Takumi Higaki de l’Université de Kumamoto a mis au place une méthode quantitative pour évaluer automatiquement les caractéristiques des buildings complexes du cytosquelette à l’aide de la technologie d’analyse d’images au microscope. Il y a approximativement 10 ans, il a rapporté que le degré de regroupement du cytosquelette pouvait être évalué par un indice numérique qu’il appelait « l’asymétrie de la distribution d’intensité » à partir d’images microscopiques colorées par fluorescence du cytosquelette. Cette strategy est aujourd’hui largement utilisée mais elle pose un problème les ailments de faisceau ne peuvent pas être évaluées avec précision dans un regroupement excessif ou lorsque l’image microscopique contient beaucoup de flou optique.



Par conséquent, le Dr Higaki et un nouveau groupe de recherche collaboratif ont mis au stage une nouvelle procedure d’évaluation quantitative des faisceaux cytosquelettiques qui est à la fois additionally reasonable et polyvalent que l’une des méthodes décrites ci-dessus. Grâce à des simulations informatiques graphiques du regroupement du cytosquelette, ils ont constaté que le coefficient de variation des intensités des pixels du cytosquelette reflétait bien l’état du faisceau ils ont effectué une analyse comparative entre les méthodes existantes et la nouvelle méthode, et ont constaté que la méthode proposée était as well as wise à la détection des états de faisceau que les autres méthodes. Ils ont également découvert qu’il pouvait être appliqué à une multitude d’échantillons biologiques et de microscopes. En outre, ils ont étudié l’effet de la méthode proposée sur le flou optique – une cause majeure de dégradation de l’image dans les visuals microscopiques – et ont constaté qu’elle était suffisante pour une évaluation quantitative de l’état du faisceau

« Cette technologie permettra l’évaluation quantitative de l’état des faisceaux cytosquelettiques à partir d’un ensemble plus diversifié d’images microscopiques. Nous prévoyons qu’elle améliorera considérablement notre compréhension des cellules en approfondissant notre compréhension des constructions d’ordre supérieur du cytosquelette », a déclaré le Dr Higaki. « Étant donné que le regroupement du cytosquelette peut maintenant être mesuré avec précision, même à partir d’images peu claires acquises avec un équipement microscopique peu coûteux, de nouvelles informations peuvent être obtenues en réanalysant la grande quantité de données d’images microscopiques qui n’avaient pas été pleinement utilisées dans le passé. »