Une nouvelle méthode pourrait aider à estimer la propagation des maladies de la faune sauvage

  • Une nouvelle méthode pourrait aider à estimer la prévalence des maladies chez la faune sauvage et déterminer le nombre d'échantillons nécessaires pour détecter une maladie.
  • Les formules actuellement utilisées pour déterminer la taille des échantillons supposent que les animaux d'une population contractent des maladies de manière indépendante, ce qui ne correspond pas à la réalité où les populations sont regroupées et les individus sont susceptibles de propager des maladies contagieuses.
  • Cette méthode peut être utilisée pour diverses espèces animales et une application en ligne est en cours de développement pour aider les biologistes sur le terrain à estimer le nombre d'individus à échantillonner pour obtenir une compréhension réaliste de la prévalence de la maladie.

Une nouvelle méthode pourrait être utilisée pour estimer la prévalence de la maladie chez la faune sauvage en liberté et aider à déterminer le nombre d’échantillons nécessaires pour détecter une maladie.

Les agences chargées de la faune sauvage manquent souvent de ressources financières et de key-d’œuvre pour collecter suffisamment d’échantillons afin de mesurer avec précision l’ampleur de la propagation d’une maladie. Afin de prévenir les pandémies humaines et animales d’origine sauvage, comme celle du COVID-19, les espèces clés doivent être efficacement surveillées pour détecter les maladies émergentes qui peuvent passer des animaux aux humains.

Jusqu’à présent, les formules largement utilisées pour déterminer la taille des échantillons supposent que les animaux d’une population contractent des maladies indépendamment les uns des autres. En réalité, les populations sont souvent regroupées, où les individus se rassemblent en groupes familiaux et partagent espace et habitat. En raison de cette proximité, les individus au sein du groupe sont susceptibles de propager des maladies contagieuses entre eux.

S’il est attainable d’échantillonner la population de manière aléatoire, l’échantillonnage d’un individu dans une grappe familiale de cerfs peut suggérer si le reste de la famille est également infecté ou non, car or truck tous les membres sont corrélés les uns aux autres. Si un échantillonnage aléatoire est feasible, la corrélation entre les individus au sein des grappes réduit la taille effective de la population, ce qui suggère que les biologistes pourraient collecter moins d’échantillons pour prédire la prévalence de la maladie.

“Le cadre est si versatile que nous pouvons l’utiliser pour n’importe quel animal”, a déclaré Krysten Schuler, professeure adjointe de recherche au Département de santé publique et écosystémique de l’Université Cornell. “Si nous pensons aux oiseaux migrant et formant d’énormes troupeaux, par rapport à un élan qui pourrait être solitaire et n’interagir pas en groupe, cela a un affect sur la taille de notre échantillon.”

Schuler est co-auteur correspondant de l’étude, publiée dans le Journal of Agricultural, Organic and Environmental Stats. James Booth, professeur au Département de statistique et de science des données de Cornell, est l’autre auteur correspondant.

Pour que la méthode fonctionne au mieux, une maladie doit être contagieuse, les espèces sauvages d’intérêt doivent avoir tendance à se regrouper de manière prévisible et les échantillons doivent être collectés au hasard auprès d’individus provenant d’autant de groupes différents que probable.

Les chercheurs se sont concentrés sur la maladie débilitante chronique (MDC) chez les cerfs comme étude de cas. Les cerfs ont tendance à se regrouper en groupes familiaux comptant en moyenne cinq individus, et la MDC est très contagieuse.

L’un des inconvénients de cette méthode est que les biologistes sont souvent contraints de procéder à un échantillonnage aléatoire very simple, et que les areas pratiques de la manière dont les échantillons sont collectés peuvent en fait augmenter les exigences en matière de taille d’échantillon malgré la corrélation avec les groupes familiaux.

Étant donné que les biologistes sur le terrain ne savent pas toujours combien d’animaux échantillonner de manière réaliste pour obtenir des informations sur la prévalence de la maladie, une software en ligne en cours de développement pourrait aider, a déclaré Schuler. Une fois disponibles, un biologiste pourrait un jour saisir des informations sur un animal particulier, telles que son histoire naturelle, la période de l’année, s’il s’agit d’une copy et dans quelle mesure ces animaux sont en get in touch with les uns avec les autres pour propager la maladie, ainsi que la maladie elle-même. L’application fournirait alors une estimation du nombre d’individus à échantillonner pour obtenir une compréhension réaliste de la prévalence de la maladie.

La recherche a été financée par le Programme de restauration de la faune et des poissons sportifs.