Les spongieuses asiatiques se nourrissent d’un huge éventail de plantes et d’arbres importants. La rouille vésiculeuse du pin blanc peut tuer les jeunes arbres en seulement quelques années. Mais il n’est pas toujours facile de détecter la présence de ces espèces destructrices simplement en regardant des taches et des bosses sur un arbre, ou à l’extérieur d’un cargo.



Désormais, une nouvelle méthode de détection rapide de l’ADN mise au issue à l’Université de la Colombie-Britannique peut identifier ces ravageurs et brokers pathogènes en moins de deux heures, sans recourir à des procédés ou produits chimiques compliqués – un obtain de temps substantiel par rapport aux plusieurs jours qu’il faut actuellement pour envoyer des échantillons à un laboratoire pour les tests.

« Parfois, un endroit n’est qu’un endroit », explique le professeur de foresterie Richard Hamelin, qui a conçu le système avec des collaborateurs de l’UBC, de Ressources naturelles Canada et de l’Agence canadienne d’inspection des aliments. « D’autres fois, c’est un champignon mortel ou un insecte exotique qui a fait du prevent sur un conteneur d’expédition et qui a le potentiel de décimer les parcs, les forêts et les fermes locaux. Vous voulez donc savoir dès que doable ce que vous regardez, afin que vous puissiez collecter plus d’échantillons pour évaluer l’étendue de l’invasion ou commencer à formuler un prepare d’action.  »



La recherche de Hamelin se concentre sur l’utilisation de la génomique pour concevoir de meilleures méthodes de détection et de surveillance des ravageurs envahissants et des brokers pathogènes qui menacent les forêts. Depuis près de 25 ans, il recherche un examination ADN rapide, précis et peu coûteux qui peut être effectué même dans des endroits, comme les forêts, sans Net rapide ni alimentation électrique régulière.

Il l’a peut-être trouvé. La méthode, démontrée l’an dernier lors d’un aperçu pour les décideurs forestiers à Ottawa, est uncomplicated. De minuscules échantillons comme des functions de feuilles ou de branches, ou des parties d’insectes comme des ailes et des antennes, sont déposés dans un tube et insérés dans un petit appareil alimenté par batterie (le thermocycleur Franklin, fabriqué par Biomeme, basé à Philadelphie). L’appareil vérifie si ces fragments d’ADN correspondent au matériel génomique de l’espèce cible et génère un signal qui peut être visualisé sur un smartphone couplé.

« Avec ce système, nous pouvons dire avec une précision de près de 100% s’il s’agit d’une correspondance ou non, si nous examinons une espèce envahissante menaçante ou une espèce bénigne », a déclaré Hamelin. « Nous pouvons analyser jusqu’à neuf échantillons de la même espèce ou d’espèces différentes à la fois, et tout est assez léger – le thermocycleur ne pèse que 1,3 kilos – pour tenir dans votre sac à dos avec suffisamment d’espace. »

La méthode repose sur les exams PCR, la méthode qui est actuellement également la norme de référence pour COVID-19. Les tests PCR analysent efficacement même des quantités infimes d’ADN en amplifiant (en appliquant des cycles de chauffage et de refroidissement) une partie du matériel génétique à un niveau où il peut être détecté.

La recherche de Hamelin a été financée par Génome Canada, Genome BC et Génome Québec et publiée dans PLOS A single. L’équipe de l’UBC, y compris l’auteur principal Arnaud Capron, a testé cette approche sur des espèces telles que la spongieuse asiatique, la rouille vésiculeuse du pin blanc et le pathogène de la mort subite du chêne, qui figurent parmi les ravageurs envahissants les moreover destructeurs au monde.

« Notre foresterie, notre agriculture et notre horticulture sont des industries vitales qui contribuent des milliards de bucks à l’économie du Canada, il est donc essentiel de les protéger de leurs ennemis », a ajouté Hamelin. « Avec une détection précoce et une surveillance constante, nous pouvons nous assurer que les problèmes potentiels sont étouffés, pour ainsi dire, dans l’œuf. »