Béatrice Garnier
“Il s’agit de connaissances essentielles dont nous avons besoin pour lutter contre les futures pandémies”, a déclaré Dmitry Korkin, professeur d’informatique de Harold L. Jurist ’61 et Heather E. Jurist Dean et chercheur principal du projet. “La compréhension de l’enveloppe du virus SARS-COV-2 devrait nous permettre de modéliser le processus réel de fixation du virus à la cellule et d’appliquer ces connaissances à notre compréhension des thérapies au niveau moléculaire. Par exemple, remark l’activité virale peut-elle être inhibée ? par des médicaments antiviraux ? Combien de blocage antiviral est nécessaire pour empêcher l’interaction virus-hôte ? Nous ne le savons pas. Mais c’est la meilleure selected que nous puissions faire en ce moment – pour pouvoir simuler des processus réels.
En introduisant des informations de séquençage génétique et des quantités massives de données du monde réel sur le virus pandémique dans un superordinateur au Texas, Korkin et son équipe, travaillant en partenariat avec un groupe dirigé par Siewert-Jan Marrink de l’Université de Groningue, aux Pays-Bas, ont produit un système informatique modèle de l’enveloppe du virus, ou coquille externe, dans un “détail quasi atomistique” qui était jusqu’à présent hors de portée des microscopes et des strategies d’imagerie les furthermore puissants.
Korkin a déclaré que les travaux ont également conduit à une meilleure compréhension des protéines M en particulier : des composants sous-estimés et négligés de l’enveloppe du virus.
Les protéines M forment des entités appelées dimères avec une copie l’une de l’autre et jouent un rôle dans le changement de forme de la particule en gardant la construction globalement adaptable tout en fournissant une framework triangulaire en forme de maille à l’intérieur qui la rend remarquablement résistante, a déclaré Korkin. En revanche, à l’extérieur, les protéines s’assemblent en de mystérieuses structures ressemblant à des filaments qui ont intrigué les scientifiques qui ont vu les résultats de Korkin, et nécessiteront une étude furthermore approfondie.
Korkin a déclaré que le modèle structurel développé par les chercheurs élargit ce que l’on savait déjà sur l’architecture de l’enveloppe du virus SARS-COV-2 et les précédentes épidémies liées au SRAS et au MERS. Le protocole de calcul utilisé pour créer le modèle pourrait également être appliqué pour modéliser furthermore rapidement les futurs coronavirus, a-t-il déclaré. Une image additionally claire de la composition du virus pourrait révéler des vulnérabilités cruciales.
“Les propriétés d’enveloppe du SRAS-COV-2 sont susceptibles d’être similaires à celles d’autres coronavirus”, a-t-il déclaré. “À terme, les connaissances sur les propriétés des protéines membranaires des coronavirus pourraient conduire à de nouvelles thérapies et vaccins pour les futurs virus.”
Les nouvelles découvertes publiées dans Structure ont duré trois ans et se sont appuyées sur les travaux de Korkin au début de la pandémie pour fournir la première feuille de route 3D du virus, basée sur les informations de séquence génétique de la première souche isolée en Chine.
