Mélanie Thomas
Les rhinocéros appartiennent à un ordre de mammifères appelé ongulés à doigts impairs qui comprend également les chevaux et les tapirs. On les trouve en Afrique et en Asie. Jusqu’à récemment, des preuves suggéraient que tout au prolonged de leur histoire évolutive, les gammarétrovirus tels que le virus de la leucémie murine n’avaient pas colonisé leurs génomes, contrairement à la plupart des autres ordres de mammifères. Le processus de colonisation est appelé endogénéisation rétrovirale et a eu pour résultat que la plupart des génomes de mammifères sont composés de jusqu’à 10 % de séquences de form rétroviral. Une analyse des génomes de rhinocéros modernes et éteints dirigée par l’Institut allemand Leibniz pour la recherche sur les zoos et la faune (Leibniz-IZW) a maintenant révélé que les rhinocéros africains ont des dizaines de gammarétrovirus dans leurs génomes absents des génomes des espèces de rhinocéros asiatiques, comme le Sumatra et rhinocéros de Java, et que le rhinocéros noir d’Afrique a deux groupes apparentés, un absent des rhinocéros blancs. La restriction des gammarétrovirus aux rhinocéros africains et la parenté étroite des virus avec les virus des rongeurs, en particulier ceux des rongeurs africains, suggèrent que les rhinocéros africains ont été infectés par une variante virale exogène et que leurs génomes ont été colonisés en Afrique. Les travaux sont publiés dans la revue scientifique Journal of Virology.
Les rétrovirus tels que l’agent causal du sida, le VIH-1, sont uniques parmi les virus en ce sens qu’ils doivent s’intégrer dans l’ADN de l’hôte dans le cadre de leur cycle de réplication. Si cela se produit dans la lignée germinale des spermatocytes ou des ovocytes, ils peuvent devenir une partie du génome de l’hôte qui est héritée par la génération suivante et sont ensuite présents dans chaque cellule des organes de la progéniture. Ce processus évolutif s’est produit si souvent qu’en moyenne jusqu’à 10 % du génome des mammifères est constitué de rétrovirus ou de leurs restes. Une étude précédente des génomes disponibles des chevaux et de leurs mother and father a suggéré qu’eux, ainsi que les rhinocéros et les tapirs, n’avaient pas été envahis par les gammarétrovirus, un groupe de virus apparentés aux virus de souris et d’oiseaux qui ont colonisé avec succès la plupart des génomes de mammifères.
“Nous avions des données sur plusieurs espèces de rhinocéros pour lesquelles nous avons continué à trouver de grandes quantités de gammarétrovirus. Lorsque nous avons utilisé des génomes de référence beaucoup furthermore récents et plus complets de rhinocéros modernes et éteints, nous avons constaté que seuls les rhinocéros africains avaient été colonisés”, déclare le Dr Kyriakos Tsangaras, auteur principal de cet report. étude.
En collaboration avec des collègues d’Australie et d’Allemagne, l’équipe scientifique a découvert qu’en fait deux groupes viraux différents avaient colonisé les rhinocéros d’Afrique. L’un d’eux n’avait colonisé que le rhinocéros noir (Diceros bicornis) et non le rhinocéros blanc (Ceratotherium simum) et était évolutivement plus jeune que celui partagé par les deux. Comme les deux groupes sont limités aux rhinocéros africains, l’étude suggère que la lignée des rhinocéros africains a été infectée et que leurs génomes ont été colonisés en Afrique, et c’est pourquoi les gammarétrovirus respectifs ne se trouvent pas chez les rhinocéros asiatiques et autres mothers and fathers de rhinocéros.
“Cela se résume finalement au manque de séquences de référence de haute qualité de la faune”, explique le professeur Alex Greenwood, chef du département des maladies de la faune au Leibniz-IZW. “Bien que les choses se soient beaucoup améliorées depuis le séquençage du leading génome humain, vous manquez des choses telles que l’histoire virale lorsque les bases de données manquent de tant d’espèces ou de génomes de référence de haute qualité de nombreuses espèces. C’est vraiment un autre exemple de la raison pour laquelle nous avons besoin de in addition de génome séquences de référence de la faune parce que nous ne savons pas quelles autres choses nous manquent et quelles conclusions nous tirons sur la présence et l’absence de séquences qui peuvent s’avérer être une conséquence de trop peu d’informations.
