Une nouvelle cible médicamenteuse potentielle a été identifiée dans le SRAS CoV-2 – le virus qui cause le COVID-19 – par des scientifiques qui affirment que plusieurs médicaments seront probablement nécessaires pour répondre à la pandémie.



Des scientifiques de la Northwestern University Feinberg School of Medicine ont cartographié la structure atomique de deux protéines critiques dans un complexe, nsp10 / 16. Ces protéines modifient le matériel génétique du virus pour le faire ressembler davantage à l’ARN de la cellule hôte (humaine).

Cela permet au virus de se cacher des cellules, ce qui lui donne le temps de se multiplier. Si un médicament peut être développé pour inhiber nsp10 / nsp16, le système immunitaire devrait être capable de détecter le virus et de l’éradiquer plus rapidement.



« Il s’agit d’une très belle cible, car il s’agit d’une protéine absolument essentielle à la réplication du virus », a déclaré l’investigatrice principale Karla Satchell.

Satchell est professeur de microbiologie-immunologie au Northwestern et directeur du Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID), un consortium international de scientifiques qui étudient la structure du virus pour faciliter le développement de médicaments.

L’équipe de Satchell envoie la nouvelle protéine à l’Université Purdue, le site de découverte de médicaments du centre, pour y rechercher de nouveaux inhibiteurs qui pourraient être développés en tant que nouveaux médicaments.

La protéine nsp10 / nsp16 est appelée ARN méthyltransférase ou MTase. Il est composé de deux protéines liées ensemble, ce qui rend plus difficile le travail avec. L’association des deux morceaux ensemble est nécessaire pour fabriquer une protéine fonctionnelle, selon des recherches antérieures sur le SRAS.

La structure de nsp10 / 16 a été dévoilée à la communauté scientifique le 18 mars sur la banque de données de protéines RSCB.

Il s’agit de la quatrième structure protéique d’une cible médicamenteuse potentielle du SRAS-CoV-2 déterminée par l’équipe de scientifiques du CSGID.

« Nous avons besoin de plusieurs médicaments pour traiter ce virus, car cette maladie est susceptible d’être avec nous pendant longtemps », a déclaré Satchell. « Il ne suffit pas de développer un seul médicament. Si COVID-19 développe une résistance à un médicament, alors nous en avons besoin d’autres. »

Le centre se bat pour libérer plus de structures pour le développement de médicaments. L’objectif du centre est de déterminer les structures de toutes les protéines qui sont des cibles médicamenteuses potentielles. L’équipe collabore également pour fournir des protéines aux chercheurs pour la conception de vaccins améliorés.

Le personnel de LS-CAT a travaillé rapidement avec APS et Satchell pour fournir un accès rapide à la ligne de lumière pendant un week-end spécifiquement pour collecter des données pour ce projet.

« Le centre a montré une grande capacité à apporter la biologie des structures à la communauté scientifique à un rythme sans précédent », a déclaré Satchell. Mais leur travail est devenu plus difficile car de nombreuses universités ont réduit leurs activités et certains laboratoires ont fermé complètement.

« Notre capacité à faire des expériences diminue », a déclaré Satchell. Pourtant, le centre continuera de libérer de nouvelles structures jusqu’à ce qu’elles atteignent leur objectif, a-t-elle déclaré.

Des structures de trois autres protéines importantes pour la réplication du virus ont également été publiées: l’endonucléase nsp15, le ribose phosphate nsp3 ADP et la réplicase nsp9. Ces structures ont été déterminées par les scientifiques du centre de l’Université de Chicago dirigés par le professeur Andrzej Joachimiak, Distinguished Fellow d’Argonne, qui est également professeur adjoint au Northwestern. Tous les travaux menés par les équipes de l’Université de Chicago et du Nord-Ouest ont été conçus par l’équipe bioinformatique d’Adam Godzik de l’Université de Californie à Riverside, sur la base de recherches menées dans le SRAS.

Le CSGID est soutenu par un contrat de l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses (NIAID), qui fait partie des National Institutes of Health, en partie pour servir de site d’intervention pour mener des recherches sur la biologie structurelle en cas d’épidémie de maladie infectieuse inattendue. Le NIAID travaille en étroite collaboration avec le Centre depuis début janvier pour coordonner les activités du centre avec d’autres recherches soutenues par le NIAID pour permettre la découverte de médicaments.

Cette étude a été financée par le contrat HHSN272201700060C de l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses, une partie du NIH.