Guillaume Rolland
Depuis 2016, les progrès réalisés dans la réduction de l’incidence et des décès liés au paludisme au cours de la dernière décennie se sont ralentis. En moreover de cela, les limitations mises en spot pour contenir la pandémie de COVID-19 ont encore limité les programmes de lutte contre le paludisme tels que la distribution de masse de moustiquaires et les campagnes de pulvérisation intradomiciliaire à effet rémanent. Pour retrouver l’élan vers l’élimination du paludisme, les scientifiques se sont de in addition en in addition tournés vers la génomique des parasites du paludisme pour mieux comprendre l’épidémiologie et la dynamique de transmission, ainsi que la base génétique sous-jacente à la résistance aux médicaments et à la gravité de la maladie.
« Une impression complète d’une populace de parasites nécessite une compréhension de ceux-ci au niveau du génome individuel », explique le professeur Akira Kaneko du département de parasitologie de la faculté de médecine de l’université de la ville d’Osaka.
Au cours de la dernière décennie, le professeur Kaneko et ses collaborateurs ont mené diverses études sur le paludisme dans et autour du lac Victoria, au Kenya, où la charge de morbidité est l’une des plus élevées du pays, afin de trouver des moyens d’éliminer le paludisme avec succès. Pour mieux comprendre la diversité génomique et la dynamique des populations de Plasmodium falciparum, le parasite du paludisme le additionally mortel chez l’homme, Kaneko et ses collaborateurs ont généré des données sur la séquence du génome entier à partir de 48 isolats de parasites et les ont comparés avec des parasites d’autres régions d’Afrique. Ils ont décrit leurs découvertes dans la revue Scientific Experiences.
Des analyses basées sur des polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) ou des mutations ponctuelles ont montré que les parasites P. falciparum du lac Victoria formaient une sous-inhabitants distincte au sein de la plus grande populace de parasites d’Afrique de l’Est, causée en partie par la additionally grande contribution des parasites d’Afrique centrale aux génomes ancestraux du lac. Parasites de Victoria. De furthermore, l’équipe a identifié un specific nombre de SNP qui peuvent potentiellement être utilisés dans un outil de surveillance moléculaire pour déterminer les principales voies de transmission et de migration de P. falciparum. « Les SNP spécifiques à une populace que nous avons identifiés offrent un degré élevé de spécificité à petite échelle, généralement au pays d’origine », déclare le professeur Kaneko. « Combinez-les avec la vue régionale ou continentale additionally huge obtenue à partir des SNP organellaires spécifiques à une inhabitants, et nous pourrions avoir le degré de résolution nécessaire pour générer un outil de surveillance moléculaire efficace. »
Un autre élément significant de l’image était les marqueurs de résistance aux médicaments que l’équipe a observés circulant parmi les isolats de P. falciparum autour du lac Victoria. Ils ont constaté la persistance du principal marqueur de résistance au médicament chloroquine, ainsi que des fréquences élevées de mutations associées à la résistance à la sulfadoxine-pyriméthamine (SP). L’équipe a estimé que l’utilisation keep on de la SP comme traitement préventif intermittent par les femmes enceintes (TPIp) fournit probablement une pression sélective suffisante pour maintenir ces polymorphismes chez P. falciparum.
“Nous sommes particulièrement enthousiasmés par l’application potentielle des données que nous avons trouvées concernant les variants de P. falciparum et les biomarqueurs connus de résistance aux médicaments que nous avons observés dans les isolats de parasites de la région”, a déclaré le Dr Wataru Kagaya, professeur de médecine au département de parasitologie d’Osaka. École supérieure de médecine de l’Université de la ville. Une en particulier s’est démarquée. Ils ont confirmé la présence de la mutation S160N/T dans le gène Pfap2mu, qui a été documentée pour la première fois chez des enfants kényans présentant un retard de clairance parasitaire lorsqu’ils étaient traités par des combinaisons thérapeutiques à foundation d’artémisinine (ACT), actuellement le traitement de première intention du paludisme simple. « Notre travail devrait aider à la gestion clinique et au contrôle des maladies grâce à des activités de surveillance dans les régions à forte charge de paludisme », ajoute Kagaya.
