Les chercheurs du St. Jude Kid’s Research Hospital ont démontré qu’un séquençage génomique complet de tous les patients pédiatriques atteints de most cancers est faisable et essentiel pour capitaliser sur le potentiel de sauvetage de la médecine de précision. Les résultats de l’étude St. Jude Genomes for Youngsters sont publiés aujourd’hui en ligne dans la revue Cancer Discovery.



Le séquençage du génome entier et de l’exome entier de l’ADN de la lignée germinale a été proposé aux 309 people qui ont participé à l’étude. Le séquençage du génome entier, de l’exome entier et de l’ARN de l’ADN tumoral a été réalisé pour les 253 people pour lesquels des échantillons tumoraux adéquats étaient disponibles.

Dans l’ensemble, 86 % des sufferers présentaient au moins une variation cliniquement significative de l’ADN tumoral ou germinatif. Ceux-ci comprenaient des variantes liées au diagnostic, au pronostic, à la thérapie ou à la prédisposition au cancer. Les chercheurs ont estimé qu’un individual sur cinq présentait des mutations cliniquement pertinentes qui n’auraient pas été détectées à l’aide de méthodes de séquençage regular.



« Certaines des découvertes les as well as pertinentes sur le program clinique n’ont été possibles que parce que l’étude combinait le séquençage du génome entier avec le séquençage de l’exome entier et de l’ARN », a déclaré Jinghui Zhang, Ph.D. président du département de biologie computationnelle de St. Jude et auteur co-correspondant de la étudier.

Chaque tumeur est unique. Chaque client est special.

Le séquençage clinique complet qui inclut le séquençage du génome entier, de l’exome entier et de l’ARN n’est pas largement disponible. Mais à mesure que la technologie devient moins chère et available à un additionally grand nombre de sufferers, les chercheurs ont déclaré que le séquençage complet deviendrait un ajout vital aux soins pédiatriques contre le cancer.

« Nous voulons changer la façon de penser dans le domaine », a déclaré David Wheeler, Ph.D. directeur de l’équipe St. Jude Precision Genomics et co-auteur de l’étude.  » Nous avons montré le potentiel d’utiliser les données génomiques au niveau du affected person. Même dans les cancers pédiatriques courants, chaque tumeur est special, chaque affected person est exclusive.

« Cette étude a montré la faisabilité d’identifier les vulnérabilités tumorales et d’apprendre à les exploiter pour améliorer les soins aux sufferers », a-t-il déclaré.

Le séquençage de la tumeur a guidé le changement de traitement pour 12 des 78 sufferers de l’étude pour lesquels la norme de soins n’a pas été efficace. Chez quatre des 12 individuals, les changements ont stabilisé la maladie et prolongé la vie des individuals. Un autre client, atteint de leucémie myéloïde aiguë, est entré en rémission et a été guéri par une greffe de cellules souches sanguines.

« Grâce aux tests génomiques complets de cette étude, nous avons pu identifier clairement les variants tumorales qui pourraient être traitées avec des brokers ciblés, ouvrant ainsi la voie à la façon dont les oncologues gèrent leurs clients », a déclaré l’auteur co-correspondant Kim Nichols, MD, St. Jude Most cancers Directeur Division Prédisposition.

Constatations et détails supplémentaires

Genomes for Young ones a recruté des people entre août 2015 et mars 2017.

Dix-huit pour cent des people présentaient des variants germinales dans l’un des 156 gènes connus de prédisposition au most cancers.

Près des deux tiers des variations de la lignée germinale identifiées n’auraient pas été détectées sur la base des directives de dépistage actuelles.

Prochaines étapes

Genomes for Young ones a aidé à lancer le programme de génomique clinique de l’hôpital, qui a recruté approximativement 2 700 people atteints de most cancers à ce jour.

Pendant ce temps, les données générées par l’étude Genomes for Young children sont disponibles gratuitement pour la communauté internationale de la recherche. En partageant les données, St. Jude vise à accélérer les progrès dans la compréhension et le traitement du cancer pédiatrique. Les données sont disponibles dans St. Jude Cloud.

« Même les cancers les furthermore traitables ne sont pas curables chez tous les patients. Par exemple, la rechute reste la principale cause de décès pour le most cancers childish le furthermore courant, la leucémie lymphoblastique aiguë », a déclaré Nichols. « Être able de comprendre et de prédire quels clients répondront au traitement et lesquels ne nécessiteront pas de collecter des données génomiques complètes sur tous les clients. »