Chloé Leroy Grâce à des dispositifs de suivi de haute technologie et à faible coût, l’étude des déplacements de la faune connaît son minute Large Details. Mais jusqu’à présent, seules les personnes ayant des compétences en science des données ont pu glaner des informations significatives sur cet “âge d’or” du suivi. Un nouveau système de l’Institut Max Planck du comportement animal (MPI-AB) et de l’Université de Constance transform cela.
Le système est lié à la base de données Movebank, développée par MPI-AB et hébergée au Max Planck Computing and Knowledge Facility (MPCDF), qui stocke les données de suivi de furthermore d’un millier d’espèces animales dans le monde. Un garde forestier pourrait utiliser le système pour garder un œil sur les animaux suivis dans le parc, en créant une carte quotidienne indiquant où se trouvent les animaux. Ou, une agence de conservation travaillant avec des espèces menacées pourrait recevoir une alerte lorsqu’un regroupement soudain de details GPS suggère qu’un animal pourrait être mort.
Dans un article publié dans Movement Ecology. Alors que les programmeurs développent des outils qui deviennent librement disponibles sur la plate-forme, les utilisateurs peuvent parcourir ces outils et exécuter des analyses en quelques clics simples sur une interface Internet conviviale.
“Vous n’avez pas besoin d’un diplôme en science des données, vous n’avez pas besoin de travailler dans une université, vous n’avez pas besoin d’une licence logicielle ou d’un gros ordinateur”, déclare le leading auteur Andrea Kölzsch.”
Lorsque le zoo de Caroline du Nord a commencé à marquer et à suivre les vautours africains il y a sept ans, le personnel du zoo passait des heures chaque jour à analyser les données GPS pour déterminer s’il avait besoin de vérifier les oiseaux. Parce qu’une carcasse empoisonnée peut tuer additionally d’une centaine de vautours en quelques heures. indiqués par un regroupement de points GPS d’oiseaux marqués.
“Nous avions l’habitude d’importer manuellement les données GPS dans notre outil, d’effectuer une analyse du regroupement des oiseaux, puis de décider nous-mêmes s’il s’agissait de véritables événements d’alimentation”, explique Corinne Kendall, collaboratrice du zoo de Caroline du Nord, qui dirige le projet vautour. “C’était un travail de deux heures par jour.”
Une fois par jour, les données des balises vautours sont automatiquement transmises à Movebank.
Comme tous les outils de la plate-forme open supply. De moreover, il a été connecté de manière transparente à Earth Ranger – un logiciel de visualisation et d’analyse de données en temps réel utilisé par les gestionnaires d’aires protégées, les écologistes et les biologistes dans moreover de 50 pays – élargissant considérablement son affect et l’intégrant à une interface opérationnelle. à l’avant-garde de la defense de la faune et de ses habitats.
Selon Kendall :, mais il a également permis une enquête en temps réel sur le comportement et la conservation des vautours.”
Des possibilités d’analyse “illimitées”
qui accèdent aux données de suivi et les analysent. Comme les blocs Lego, ils peuvent être cliqués ensemble pour former des flux de travail. Par exemple, un flux de travail peut consister en un bloc pour dessiner les données, un bloc pour nettoyer les données et un bloc pour les visualiser sur une carte. “Techniquement, les analyses que les gens peuvent créer sont illimitées”, déclare l’auteur principal Kamran Safi, chef de groupe chez MPI-AB.
Pour la plupart, les programs sont codées en R – le logiciel préféré des écologistes du mouvement, vehicle il offre un code open up supply pour l’analyse d’ensembles de données comportementales complexes. Mais R a été un impediment majeur empêchant certains propriétaires de données d’analyser leurs données, auto cela nécessite une programmation en ligne de commande. ” La plupart des groupes scientifiques ou de gestion de la conservation ont, voire pas du tout, un details scientist dédié, toujours surchargé de travail, ce qui rend l’analyse des données très lente “, explique Kölzsch.
les utilisateurs sélectionnent et cliquent simplement pour faire fonctionner ce code. Et parce que le code est ouvert, la communauté peut à son tour aider à améliorer le code.
De additionally, ces flux de travail peuvent être publiés, ce qui offre une reconnaissance aux programmeurs et des analyses véritablement reproductibles.
“La publication du code supply du logiciel et de sa documentation avec les données de Movebank comble une lacune en rendant les résultats de recherche transparents et reproductibles”, déclare le co-auteur Gabriel Schneider du Conversation, Facts, Media Center de l’Université de Constance. publication de codes. “En décrivant chaque flux de travail avec des métadonnées riches, les utilisateurs pourront le comprendre et l’utiliser dans les années à venir.”
Une architecture informatique cloud-indigenous
Selon les auteurs. strong et sécurisée pour l’analyse des mouvements d’animaux, en partie grâce à son architecture informatique cloud indigenous sans serveur. Toutes les données sont stockées et analysées sur une infrastructure basée sur le cloud.
émancipé et créatif, un avenir dans lequel la science est ouverte à tous, qu’ils aient ou non les moyens d’acheter le matériel et les logiciels nécessaires”, déclare Kölzsch.
Sur le cloud. ce qui leur permet de fonctionner as well as efficacement et minimise le risque qu’une erreur dans l’une se répercute sur les autres dans le flux de travail.//www.mpcdf.mpg.de/solutions/supercomputing) et est gratuit pour tous les utilisateurs.
nous l’avons conçue pour qu’elle soit efficace et évolutive à very long terme”, déclare Brian Standley, qui soutient le projet au MPCDF.
