Il y a in addition de dix ans, les dossiers médicaux électroniques faisaient fureur, promettant de transformer les soins de santé et d’aider à orienter les décisions cliniques et les interventions de santé publique.



Avec l’arrivée du COVID-19, les chercheurs ont rapidement réalisé que les dossiers médicaux électroniques (DME) n’avaient pas atteint leur plein potentiel – en grande partie à bring about de la décentralisation généralisée des dossiers et des systèmes cliniques qui ne peuvent pas « se parler ».

Désormais, dans un work pour contourner ces obstructions, un groupe global de chercheurs a réussi à créer un référentiel centralisé de dossiers médicaux qui, en furthermore d’une collecte rapide de données, peut effectuer l’analyse et la visualisation des données.



La plate-forme, décrite le 19 août dans Character Electronic Medication, contient des données de 96 hôpitaux de cinq pays et a fourni des indices cliniques intrigants, bien que préliminaires, sur la façon dont la maladie se présente, évolue et affecte différents systèmes organiques dans différentes catégories de clients COVID-19 .

Pour l’instant, la plateforme représente in addition une preuve de concept qu’un outil entièrement évolué, prévient l’équipe de recherche, ajoutant que les observations initiales rendues possibles par les données soulèvent in addition de questions qu’elles ne répondent.

Cependant, à mesure que la collecte de données se développe et que de as well as en as well as d’institutions commencent à fournir de telles informations, l’utilité de la plate-forme évoluera en conséquence, a déclaré l’équipe.

« Le COVID-19 a pris le monde au dépourvu et a révélé d’importantes lacunes dans notre capacité à utiliser les dossiers médicaux électroniques pour recueillir des informations révélatrices qui pourraient éclairer la réponse lors d’une pandémie de changement de forme », a déclaré Isaac Kohane, auteur principal de la recherche et président du département. d’informatique biomédicale à l’Institut Blavatnik de la Harvard Healthcare School. « La nouvelle plateforme que nous avons créée montre que nous pouvons, en fait, surmonter certains de ces défis et collecter rapidement des données critiques qui peuvent nous aider à faire face à la maladie au chevet et au-delà.

Dans son rapport, l’équipe de recherche multi-institutionnelle dirigée par la Harvard Medical College fournit des informations sur l’analyse précoce des dossiers de 27 584 individuals et 187 802 analyses de laboratoire collectées au début de l’épidémie, du 1er janvier au 11 avril. Les données proviennent de 96 hôpitaux aux États-Unis, en France, en Italie, en Allemagne et à Singapour, dans le cadre du 4CE Consortium, un référentiel de recherche international de dossiers médicaux électroniques utilisés pour éclairer les études sur la pandémie de COVID-19.

« Notre travail démontre que les systèmes hospitaliers peuvent s’organiser rapidement pour collaborer au-delà des frontières, des langues et des différents systèmes de codage », a déclaré le premier auteur de l’étude, Gabriel Brat, professeur adjoint de chirurgie HMS au Beth Israel Deaconess Professional medical Center et membre du Département d’informatique biomédicale. « J’espère que nos efforts continus pour générer des informations sur le COVID-19 et améliorer le traitement encourageront d’autres personnes du monde entier à participer et à partager des données.

La nouvelle plateforme souligne la valeur d’une telle analyse agile dans la génération rapide de connaissances, en particulier lors d’une pandémie qui achieved une urgence supplémentaire à répondre à des thoughts clés, mais ces outils doivent également être abordés avec prudence et faire l’objet d’une rigueur scientifique, selon un accompagnement. éditorial rédigé par d’éminents specialists en science des données biomédicales.

« La barre pour ce travail doit être placée haute, mais nous devons aussi être capables d’agir rapidement. Des exemples tels que le 4CE Collaborative montrent que les deux peuvent être atteints », écrit Harlan Krumholz, auteur principal de l’éditorial d’accompagnement et professeur de médecine. et cardiologie et directeur du Heart for Outcomes Investigate and Evaluation à l’hôpital de Yale-New Haven.

Quel kind d’informations les DME peuvent-ils fournir ?

Dans une pandémie, en particulier celle impliquant un nouveau pathogène, une évaluation rapide des dossiers cliniques peut fournir des informations non seulement sur le taux de nouvelles infections et la prévalence de la maladie, mais également sur les principales caractéristiques cliniques qui peuvent présager de bons ou mauvais résultats, la gravité de la maladie et la nécessité de exams supplémentaires ou de certaines interventions.

Ces données peuvent également fournir des indices sur les différences d’évolution de la maladie entre divers groupes démographiques et les fluctuations indicatives des biomarqueurs associés à la fonction du cœur, des reins, du foie, du système immunitaire et plus encore. Ces informations sont particulièrement importantes dans les premières semaines et les premiers mois qui suivent l’apparition d’une nouvelle maladie et les experts en santé publique, les médecins et les décideurs deviennent aveugles. De telles données pourraient s’avérer cruciales as well as tard: les modèles indicatifs peuvent indiquer aux chercheurs remark concevoir des essais cliniques pour mieux comprendre les facteurs sous-jacents qui influencent les résultats observés. Par exemple, si les dossiers montrent des changements cohérents dans les empreintes d’une protéine qui annonce une coagulation sanguine anormale, les chercheurs peuvent choisir de concentrer leur surveillance, les traitements sur les systèmes organiques dont le dysfonctionnement est associé à ces anomalies ou de se concentrer sur les organes qui pourraient être endommagés par caillots, notamment le cerveau, le cœur et les poumons.

L’analyse des données collectées en mars démontre qu’il est achievable de créer rapidement un schéma clinique de la maladie qui pourra ensuite être complété à mesure que des détails furthermore granulaires émergent, ont déclaré les chercheurs.

Dans l’étude actuelle, les chercheurs ont suivi les données suivantes:

  • Nombre full de patients COVID-19
  • Nombre d’admissions et de sorties en unité de soins intensifs
  • Moyenne de sept jours de nouveaux cas pour 100 000 habitants par pays
  • Bilan quotidien des morts
  • Répartition démographique des people
  • Checks de laboratoire pour évaluer la fonction cardiaque, immunitaire et rénale et hépatique, mesurer le nombre de globules rouges et blancs, les marqueurs inflammatoires tels que la protéine C-réactive, ainsi que deux protéines liées à la coagulation sanguine (D-dimère) et aux lésions musculaires cardiaques (troponine )

Modèles révélateurs

Les observations du rapport comprenaient:

  • Les analyses démographiques par pays ont montré des versions de l’âge des people hospitalisés, l’Italie ayant la furthermore grande proportion de sufferers âgés (moreover de 70 ans) diagnostiqués avec le COVID-19
  • Lors de la présentation initiale à l’hôpital, les patients ont montré une cohérence remarquable dans les exams de laboratoire mesurant les fonctions cardiaque, immunitaire, de coagulation sanguine et rénale et hépatique
  • Le premier jour de l’admission, la plupart des clients avaient une maladie relativement modérée telle que mesurée par des assessments de laboratoire, les assessments initiaux montrant des anomalies modérées mais aucune sign de défaillance d’organe
  • Des anomalies majeures étaient évidentes le leading jour du diagnostic de la protéine C-réactive – une mesure de l’inflammation – et de la protéine D-dimère, un produit chimique qui mesure la coagulation sanguine, les résultats des checks s’aggravant progressivement chez les patients qui ont développé une maladie in addition grave ou décédés
  • Les niveaux de l’enzyme hépatique bilirubine, qui indiquent la fonction hépatique, étaient initialement normaux dans tous les hôpitaux, mais se sont aggravés chez les individuals hospitalisés de façon persistante, une découverte suggérant que la plupart des sufferers n’avaient pas d’insuffisance hépatique lors de la présentation initiale
  • Les niveaux de créatinine – qui mesurent dans quelle mesure les reins filtrent les déchets – ont montré de grandes variants d’un hôpital à l’autre, un résultat qui peut refléter des variants d’un pays à l’autre dans les tests, dans l’utilisation de liquides pour gérer la fonction rénale ou des différences dans le second de la présentation des patients à différents stades de la maladie
  • En moyenne, le nombre de globules blancs – une mesure de la réponse immunitaire – était dans les limites de la normale pour la plupart des individuals, mais a montré des augmentations chez ceux qui avaient une maladie grave et sont restés hospitalisés moreover longtemps

Même si les conclusions du rapport sont des observations et ne peuvent pas être utilisées pour tirer des conclusions, les tendances qu’ils indiquent pourraient fournir une base pour des études furthermore ciblées et in addition approfondies qui vont à la racine de ces observations, a déclaré l’équipe.

« Il est clair qu’au milieu d’un pathogène émergent, l’incertitude dépasse de loin les connaissances », a déclaré Kohane. « Nos endeavours établissent un cadre pour surveiller la trajectoire du COVID-19 à travers différentes catégories de sufferers et nous aident à comprendre la réponse à différentes interventions cliniques.

Les co-chercheurs comprenaient Griffin Weber, Nils Gehlenborg, Paul Avillach, Nathan Palmer, Luca Chiovato, James Cimino, Lemuel Waitman, Gilbert Omenn, Alberto Malovini Jason Moore, Brett Beaulieu-Jones Valentina Tibollo Shawn Murphy Sehi L’Yi Mark Keller Riccardo Bellazzi David Hanauer Arnaud Serret-Larmande Alba Gutierrez-Sacristan John Holmes Douglas Bell Kenneth Mandl Robert Follett Jeffrey Klann Douglas Murad Luigia Scudeller Mauro Bucalo Katie Kirchoff Jean Craig Jihad Obeid Vianney Jouhet Romain Griffier Sébastien Cossin Bertrand Moal Lav Patel Antonio Bellasi Hans Prokosch Detlef Kraska Piotr Sliz Amelia Tan Kee Yuan Ngiam Alberto Zambelli Danielle Mowery Emily Schiver Batsal Devkota Robert Bradford Mohamad Daniar Christel Daniel Vincent Benoit Romain Bey Nicolas Paris Patricia Serre Nina Orlova Julien Dubiel Martin Hilka Anne Sophie Jannot Stéphane Breant Judith Leblanc Nicolas Griffon Anita Burgun Mélodie Bernaux Arnaud Sandrin Elisa Salamanca Sylvie Cormont Thomas Ganslandt Tobias Gradinger Julien Champ Martin Boeker Patricia Martel Loic Esteve Alexandre Gramfort Olivier Grisel Damien Leprovost Thomas Moreau Gael Varoquaux Jill-Jênn Vie Demian Wassermann Arthur Mensch Charlotte Caucheteux Christian Haverkamp Guillaume Lemaitre Silvano Bosari, Ian Krantz Andrew South Tianxi Cai.

Divulgations pertinentes:

Les co-auteurs Riccardo Bellazzi de l’Université de Pavie et Arthur Mensch, de l’Université PSL, sont actionnaires de Biomeris, une société d’analyse de données biomédicales.