Une nouvelle branche sur l'arbre de vie comprend les "lions du monde microbien"

Il y a une nouvelle branche sur l’arbre de vie et elle est composée de prédateurs qui grignotent leur proie à mort.

Ces prédateurs microbiens se divisent en deux groupes, dont l’un a été surnommé les “nibblerids” parce qu’ils grignotent des morceaux de leurs proies en utilisant des constructions en forme de dents. L’autre groupe, les nébulides, mangent leurs proies entières. Et les deux comprennent une nouvelle branche ancienne sur l’arbre de vie appelée “Provora”, selon un post publié aujourd’hui dans Nature.

Lions microbiens

Comme les lions, les guépards et les prédateurs additionally familiers, ces microbes sont numériquement rares mais importants pour l’écosystème, explique l’auteur principal, le Dr Patrick Keeling, professeur au département de botanique de l’UBC. “Imaginez si vous étiez un extraterrestre et échantillonniez le Serengeti  : vous auriez beaucoup de plantes et peut-être une gazelle, mais pas de lions. Mais les lions comptent, même s’ils sont rares. Ce sont des lions du monde microbien.”

En utilisant des échantillons d’eau provenant d’habitats marins du monde entier, notamment des récifs coralliens de Curaçao, des sédiments des mers Noire et Rouge et de l’eau des océans Pacifique et Arctique du nord-est, les chercheurs ont découvert de nouveaux microbes. “J’ai remarqué que dans certains échantillons d’eau, il y avait de minuscules organismes avec deux flagelles, ou queues, qui tournaient convulsivement sur area ou nageaient très rapidement. C’est ainsi qu’a commencé ma chasse à ces microbes”, a déclaré le leading auteur, le Dr Denis Tikhonenkov, chercheur principal au Institut de biologie des eaux intérieures de l’Académie russe des sciences.

Le Dr Tikhonenkov, collaborateur de longue date des co-auteurs de l’UBC, a remarqué que dans les échantillons où ces microbes étaient présents, presque tous les autres disparaissaient après un à deux jours. Ils étaient mangés. Le Dr Tikhonenkov a nourri les prédateurs voraces avec des protozoaires pacifiques pré-développés, cultivant les organismes afin d’étudier leur ADN.

“Dans la taxonomie des organismes vivants, nous utilisons souvent le gène ‘ARNr 18S’ pour décrire la différence génétique. Par exemple, les humains diffèrent des cobayes dans ce gène de seulement 6 nucléotides. Nous avons été surpris de constater que ces microbes prédateurs diffèrent de 170 à 180 nucléotides dans le gène de l’ARNr 18S de tous les autres êtres vivants sur Terre. Il est devenu clair que nous avions découvert quelque chose de complètement nouveau et étonnant », a déclaré le Dr Tikhonenkov.

Nouvelle branche de la vie

Sur l’arbre de la vie, le règne animal serait une brindille poussant à partir de l’une des branches appelées “domaines”, la catégorie la moreover élevée de la vie. Mais assis sous les domaines, et au-dessus des royaumes, se trouvent des branches de créatures que les biologistes ont pris l’habitude d’appeler des “supergroupes”. Approximativement cinq à sept ont été trouvés, le as well as récent en 2018 – jusqu’à présent.

En savoir moreover sur ces branches de la vie potentiellement inconnues nous aide à comprendre les fondements du monde vivant et le fonctionnement de l’évolution.

“Ignorer les écosystèmes microbiens, comme nous le faisons souvent, c’est comme avoir une maison qui a besoin de réparations et simplement redécorer la delicacies, mais ignorer le toit ou les fondations”, a déclaré le Dr Keeling. “Il s’agit d’une ancienne branche de l’arbre de vie qui est à peu près aussi diversifiée que les règnes animal et fongique combinés, et personne ne savait qu’elle était là.”

Les chercheurs prévoient de séquencer des génomes entiers des organismes, ainsi que de construire des reconstructions 3D des cellules, afin d’en savoir plus sur leur organisation moléculaire, leur framework et leurs habitudes alimentaires.

Culture internationale

Cultiver les prédateurs microbiens n’était pas une mince affaire, car ils ont besoin d’un mini-écosystème avec leur nourriture et la nourriture de leur nourriture juste pour survivre dans le laboratoire. Un processus difficile en soi, les cultures ont d’abord été cultivées au Canada et en Russie, et le COVID et la guerre de la Russie avec l’Ukraine ont empêché les scientifiques russes de visiter le laboratoire au Canada ces dernières années, ralentissant la collaboration.