Marie Rousseau
Un nouvel report publié dans la revue Proceedings of the Royal Modern society B a utilisé le métabarcoding de l’ADN environnemental (eDNA) pour analyser les communautés de poissons et de zooplancton. L’étude a révélé que le mouvement de l’eau entre les ideas d’eau douce, ou la connectivité de l’eau douce, peut transporter l’ADNe. Cela fulfilled en évidence le potentiel de l’eDNA à fournir une vue complète de la biodiversité d’eau douce.
Les écosystèmes aquatiques sont reliés par des voies navigables qui permettent aux poissons, aux plantes et à d’autres organismes de se déplacer d’un endroit à un autre. Cette connectivité est importante pour la résilience des populations aquatiques, mais elle peut également rendre difficile le suivi de l’ADN de ces organismes.
L’étude, dirigée par le Dr Joanne Littlefair, chargée de cours en sciences biologiques à l’Université Queen Mary de Londres, a examiné trois réseaux de lacs contenant 21 lacs dans la forêt boréale canadienne dans la zone des lacs expérimentaux de l’IISD. Les chercheurs ont découvert que l’ADNe présent dans les lacs reflétait généralement les préférences de l’espèce en matière d’habitat, mais qu’une partie de l’ADNe était également transportée dans les lacs en aval. Les lacs présentant un degré de connectivité in addition élevé présentaient davantage de détections d’ADNe qui ne pouvaient pas être expliquées par les methods de surveillance conventionnelles.
Les résultats ont des implications pour l’utilisation de l’eDNA pour surveiller la biodiversité dans les écosystèmes d’eau douce. L’eDNA est un outil prometteur pour la surveillance de la biodiversité, mais les données doivent être interprétées à la lumière de la connectivité du paysage.
“L’ADNe peut être utilisé pour détecter la présence d’espèces qui ne sont pas facilement surveillées à l’aide de méthodes conventionnelles, y compris les espèces envahissantes, ou pour surveiller la présence d’espèces rares ou menacées”, a déclaré le Dr Littlefair. “Notre étude a montré que les enquêtes sur l’ADNe peuvent être soigneusement conçu pour prendre en compte la connectivité du système d’eau douce étudié. Dans les systèmes avec des niveaux élevés de connectivité, il est vital de collecter des échantillons à partir de plusieurs emplacements, ce qui nous permettra de dresser un tableau complet de la biodiversité actuelle. »
L’étude souligne également la nécessité de mener davantage de recherches sur les facteurs, tels que les effets du mouvement de l’eau, qui influencent la résolution spatiale de la détection de l’eDNA. Par exemple, si l’eau d’un écosystème se déplace rapidement, il peut être nécessaire de collecter davantage d’échantillons pour augmenter les prospects de détecter l’ADNe. Cette recherche contribuera à améliorer la compréhension des scientifiques sur la manière dont l’ADNe peut être utilisé pour surveiller et conserver la biodiversité aquatique.
L’étude a été financée par le Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada (CRSNG) et le département Environnement de WSP Montréal. L’étude est le fruit d’une collaboration entre des chercheurs de l’Université Queen Mary de Londres au Royaume-Uni et les establishments canadiennes suivantes : l’Université McGill, l’Université Lakehead, la Région des lacs expérimentaux de l’IISD et SHARCNET. Le Dr Littlefair a travaillé à l’Université McGill puis à QMUL pendant l’étude.
