L’étude des anciens microbiomes oraux britanniques révèle un changement après la peste noire

La deuxième pandémie de peste du milieu du XIVe siècle, également connue sous le nom de peste noire, a tué 30 à 60% de la population européenne et a profondément changé le cours de l’histoire européenne. De nouvelles recherches menées par Penn Point out et l’Université d’Adélaïde suggèrent que ce fléau, potentiellement dû aux changements de régime alimentaire et d’hygiène qui en résultent, pourrait également être associé à un changement dans la composition du microbiome oral humain vers un microbiome qui contribue aux maladies chroniques de l’ère moderne. jour les humains.

L’étude des anciens microbiomes oraux britanniques révèle un changement après la peste noire

« Les microbiomes modernes sont liés à un significant éventail de maladies chroniques, notamment l’obésité, les maladies cardiovasculaires et une mauvaise santé mentale », a déclaré Laura Weyrich, professeure agrégée d’anthropologie à Penn State. « Découvrir les origines de ces communautés microbiennes peut aider à comprendre et à gérer ces maladies. »

Selon Weyrich, on pense que les changements alimentaires ont influencé l’évolution du microbiome oral au fil du temps cependant, peu d’études ont examiné directement l’histoire des microbiomes buccaux humains dans une seule inhabitants. Weyrich a noté que certaines études ont utilisé les microbiomes de peuples autochtones vivants qui pratiquent des modes de vie traditionnels de subsistance comme substitut des microbiomes des peuples pré-industrialisés. Pourtant, cette stratégie est erronée, a-t-elle déclaré, motor vehicle les populations non industrialisées d’aujourd’hui ne possèdent peut-être pas de microbes qui reflètent fidèlement ceux qui existaient chez les ancêtres des peuples industrialisés.

De moreover, a-t-elle déclaré : « Cette recherche impose des responsabilités et des obligations inutiles aux communautés autochtones pour qu’elles participent à la recherche sur le microbiome, là où les avantages de ces études pourraient ne pas servir directement aux peuples autochtones. »

Une méthode moreover précise et éthiquement responsable consiste à examiner directement les microbiomes buccaux préservés dans la plaque dentaire calcifiée, connue sous le nom de tartre, provenant des ancêtres des peuples industrialisés, avec la permission et la collaboration des populations et des functions prenantes décédées. Dans la additionally grande étude à ce jour sur le tartre dentaire ancien, Weyrich et ses collègues ont collecté des matériaux provenant des dents de 235 individus enterrés dans 27 web pages archéologiques en Angleterre et en Écosse entre approximativement 2 200 avant JC et 1853 après JC.

Les résultats sont publiés aujourd’hui (29 novembre) dans Mother nature Microbiology.

Les chercheurs ont traité les échantillons dans un ancien laboratoire d’ADN extremely-stérile afin de minimiser la contamination. Ils ont identifié 954 espèces microbiennes et ont déterminé qu’elles appartenaient à deux communautés distinctes de bactéries — l’une dominée par le style Streptococcus — qui est commun dans les microbiomes buccaux des peuples industrialisés modernes — et l’autre par le style Methanobrevibacter — qui est est désormais largement considérée comme éteinte chez les populations industrialisées en bonne santé.

En explorant les origines de ces deux communautés, l’équipe a découvert que près de 11% de la variation totale de la composition des espèces du microbiome pourrait s’expliquer par des changements temporels, notamment l’arrivée de la deuxième pandémie de peste. Mais remark la deuxième pandémie de peste pourrait-elle contribuer à des changements dans le microbiome buccal ?

« Nous savons que les survivants de la deuxième pandémie de peste gagnaient des revenus in addition élevés et pouvaient se permettre des aliments moreover riches en calories », a déclaré Weyrich. « Il est probable que la pandémie ait déclenché des changements dans le régime alimentaire des gens qui, à leur tour, ont influencé la composition de leur microbiome oral. »

L’équipe a utilisé une nouvelle approche pour déterminer si un changement de régime alimentaire aurait pu influencer l’émergence du groupe Streptococcus et l’extinction du groupe Methanobrevibacter. Ils ont dressé une liste de différences fonctionnelles entre les bactéries des deux groupes qui pourraient être liées au régime alimentaire par exemple, les fonctions liées à la digestion riche ou faible en fibres alimentaires, au métabolisme des glucides et au métabolisme du lactose – un sucre présent dans le lait.

Les chercheurs ont découvert que les bactéries du groupe dominé par les streptocoques présentaient davantage de caractéristiques fonctionnelles qui sont significativement liées aux régimes pauvres en fibres et riches en glucides, ainsi qu’à la consommation de produits laitiers, qui caractérisent tous les régimes alimentaires modernes. En revanche, le groupe dominé par Methanobrevibacter manquait des traits associés à la consommation de produits laitiers et de sucre, qui caractérisaient le régime alimentaire de certains humains anciens.

L’équipe a en outre déterminé que le groupe Streptococcus était associé à la présence d’une maladie parodontale, caractérisée par des infections et une irritation des gencives et des os autour des dents. Lorsque cette maladie progresse, les bactéries peuvent pénétrer dans la circulation sanguine par les tissus des gencives et potentiellement provoquer des maladies respiratoires, de la polyarthrite rhumatoïde, des maladies coronariennes et des problèmes de glycémie en cas de diabète. Le groupe Methanobrevibacter, en revanche, était associé à la présence de pathologies squelettiques.

« Nos recherches suggèrent que les microbiomes oraux modernes pourraient refléter des changements passés dans le régime alimentaire, résultant de la deuxième pandémie de peste », a déclaré Weyrich. « Il est essential de noter que ce travail contribue à éclairer notre compréhension des maladies chroniques et non transmissibles modernes. »

Parmi les autres auteurs de l’article de Penn State figurent Abigail Gancz, étudiante diplômée Michelle Nixon, professeure-chercheuse adjointe en sciences et technologies de l’information Sterling Wright, étudiant diplômé Emily R. Davenport, professeur adjoint de biologie et Justin Silverman, professeur adjoint de sciences et technologies de l’information. Parmi les autres co-auteurs figurent Andrew Farrer, étudiant diplômé de l’Université d’Adélaïde Luis Arriola, étudiant diplômé, Université d’Adélaïde C. Adler, maître de conférences, École de médecine dentaire, Université de Sydney Neville Gully, doyen adjoint à l’apprentissage et à l’enseignement, Adelaide Dental Faculty, Université d’Adélaïde Alan Cooper Kate Britton, professeur d’archéologie, Université d’Aberdeen et Keith Dobney, directeur de l’École d’enquête historique et philosophique, Université de Sydney.

Le Conseil australien de la recherche, la Countrywide Science Basis et Penn Point out ont soutenu cette recherche.