Une équipe de recherche clinique du Département de pédiatrie et de médecine de l’adolescent et du Département d’obstétrique et de gynécologie, École de médecine clinique, Faculté de médecine LKS, Université de Hong Kong (HKUMed) mène la découverte de l’application de cellules de liquide amniotique obtenues au cours de 16- 24 semaines de grossesse en tant que nouveau variety d’échantillon pour le séquençage de l’ARN dans le diagnostic prénatal afin d’aider davantage de familles avec une prise en demand clinique personnalisée. Il s’agit de la première étude de preuve de strategy à démontrer l’utilité clinique potentielle du séquençage de l’ARN des cellules du liquide amniotique dans la littérature. Les résultats révolutionnaires ont été publiés dans la revue universitaire, npj Genomic Medicine.
Les maladies rares sont généralement d’origine génétique. Bien qu’individuellement rares, les maladies collectivement rares se sont avérées être 1 sur 67 dans la population de Hong Kong, sur la base de l’étude précédente de l’équipe. L’identification de la induce génétique dans les maladies rares peut fournir des conseils précis pour une meilleure gestion clinique et une foreseeable future planification de la grossesse, ce qui est essentiel pour accompagner les sufferers. Les technologies actuelles de diagnostic prénatal sont en grande partie basées sur l’ADN, avec une grande proportion (60-70%) qui reste non diagnostiquée, ce qui entraîne une incertitude clinique et une anxiété parentale. Récemment, le séquençage de l’ARN s’est avéré augmenter le rendement diagnostique de 10 % à 36 %, cependant, aucune de ces études ne s’est concentrée sur le diagnostic prénatal. En outre, malgré la disponibilité d’une grande foundation de données bien établie cataloguant le profil d’expression génique de différents tissus pour adultes, un ensemble de données similaire accessible au public pour les cellules du liquide amniotique reflétant le stade embryologique et fœtal fait défaut. D’autres études et recherches sur le séquençage de l’ARN en milieu prénatal sont donc nécessaires.
L’équipe de recherche a démontré l’utilité clinique potentielle du séquençage de l’ARN des cellules du liquide amniotique. Une ligne de base pour le profil d’expression génique des cellules du liquide amniotique est établie en effectuant un séquençage d’ARN sur plus de 50 échantillons de liquide amniotique. L’établissement du profil d’expression génique est une étape essentielle dans l’application du séquençage de l’ARN au flux de travail de diagnostic clinique actuellement sélectionné. Ils ont découvert que le nombre de gènes bien exprimés dans les cellules du liquide amniotique était equivalent à celui d’autres tissus cliniquement accessibles couramment utilisés pour le diagnostic génétique dans différentes catégories de maladies. L’équipe de recherche a également comparé les données de séquençage de l’ARN de quatre fœtus affectés présentant des anomalies congénitales structurelles avec la ligne de base établie pour détecter les valeurs aberrantes potentielles. En collaboration avec l’Université strategy de Munich en Allemagne, un pipeline bioinformatique a été adapté pour améliorer la détection des valeurs aberrantes pour une analyse ultérieure. Une curation additionally approfondie a montré que des valeurs aberrantes peuvent être identifiées dans les gènes associés aux anomalies congénitales structurelles correspondantes chez les quatre fœtus affectés. L’identification des valeurs aberrantes fournit moreover de preuves au niveau de l’ARN pour aider au diagnostic.
Les résultats de cette étude ont des implications importantes dans la résolution des maladies rares non diagnostiquées à Hong Kong. C’est la première fois que le séquençage de l’ARN des cellules du liquide amniotique est signalé comme offrant une utilité clinique potentielle dans le diagnostic prénatal dans la littérature. Avec l’identification de la cause génétique, une médecine de précision telle qu’une prise en charge clinique sur mesure et un diagnostic génétique préimplantatoire pour les familles ayant des antécédents familiaux est doable.
Cette étude a été sélectionnée comme “Reviewers’ Preference Summary” (leading 10% des résumés d’affiches) lors de la réunion annuelle 2022 de l’American Modern society of Human Genetics (ASHG), l’une des moreover grandes conférences de ce form, au cours de laquelle des scientifiques du monde entier sont sélectionnés pour présenter en collaboration leurs résultats de recherche de pointe. « C’est un honneur pour l’affiche HKUMed d’être sélectionnée et classée parmi les 10 % des meilleurs résumés d’affiches de cette conférence internationale. Le séquençage de l’ARN a un grand potentiel dans la résolution de difficulties génétiques inexpliqués. Nous continuerons à renforcer les liens et les collaborations avec des establishments à Hong Kong et à l’étranger, à contribuer à la recherche scientifique internationale et à apporter des avantages à nos individuals locaux », a déclaré le Dr Brian Chung Hon-yin, généticien clinique, professeur agrégé clinique, Département de pédiatrie et Médecine de l’adolescence, École de médecine clinique, HKUMed.
Le Dr Anita Kan Sik-yau, professeure agrégée clinique honoraire, Département d’obstétrique et de gynécologie, École de médecine clinique, HKUMed cum Directrice adjointe du laboratoire de diagnostic prénatal de l’hôpital Tsan Yuk a ajouté : « À l’occasion mémorable de l’hôpital Tsan Yuk (TYH ) du 100e anniversaire, cette étude a démontré le support exceptionnel de TYH pour Hong Kong au cours du siècle dernier et ses efforts continus pour contribuer à tous ceux qui en ont besoin, parallèlement à une recherche innovante.
L’équipe de recherche
Cette recherche a été dirigée par le Dr Brian Chung Hon-yin, professeur agrégé de clinique, Département de pédiatrie et de médecine de l’adolescent, École de médecine clinique, HKUMed Dr Anita Kan Sik-yau, professeur agrégé clinique honoraire, Département d’obstétrique et de gynécologie, École de médecine clinique, HKUMed. Mianne Lee, candidate au MPhil, et le Dr Anna Kwong Ka-yee, assistante de recherche, Département de pédiatrie et de médecine de l’adolescent, École de médecine clinique, HKUMed sont les premiers auteurs.
Parmi les autres contributeurs figuraient le Dr Christopher Mak Chun-yu, Martin Chui Male-chun, Jeffrey Chau Fong-ting, Département de pédiatrie et de médecine de l’adolescent, École de médecine clinique, HKUMed Dr Kelvin Chan Yuen-kwong, Dr Sandy Au Leung-kuen et Lo Hei-man, Département d’obstétrique et de gynécologie, École de médecine clinique, HKUMed. Les collaborateurs internationaux étaient le professeur Julien Gagneur et le Dr Vicente A Yépez du Département d’informatique de l’Université procedure de Munich, Garching, Allemagne.
Cette étude a été soutenue par la Société pour le soulagement des enfants handicapés, le Fonds de recherche médicale et de santé du Bureau de la santé, le gouvernement de la Région administrative spéciale de Hong Kong et la Fondation M. et Mme Edward CM Wong.