Le COVID n’est pas encore maîtrisé. Malgré une multitude de vaccins, d’anticorps monoclonaux et d’antiviraux, le virus carry on de muter et de nous échapper. Une alternative que les scientifiques explorent depuis les premiers jours de la pandémie peut se présenter sous la forme de minuscules anticorps dérivés de lamas, qui ciblent diverses parties de la protéine de pointe du SRAS-CoV-2.
Les auteurs ont déjà utilisé cette méthode optimisée pour identifier plusieurs nanocorps qui semblent fonctionner contre des variantes clés du virus, y compris omicron. “COVID va clairement être un problème pendant un selected temps”, déclare Rout. “Nous montrons que bon nombre des nanocorps que nous avons identifiés avec cette méthode ciblent des variants préoccupants, ils ont donc un réel potentiel thérapeutique.”
Nouveauté Nanobody
Les nanocorps peuvent fonctionner là où les anticorps in addition gros échouent, en partie en raison de leur taille compacte. Des études ont montré que les nanocorps peuvent se faufiler dans des events du virus SARS-CoV-2 que les anticorps plus gros ne peuvent pas atteindre. Les nanocorps ont également des durées de conservation inhabituellement longues, coûtent très peu à produire en masse et, en raison de leurs propriétés physiques uniques, pourraient théoriquement être inhalés.
Les camélidés tels que les lamas produisent naturellement des nanocorps lorsqu’ils sont exposés à un virus, et Rout et ses collègues ont développé d’énormes bibliothèques de nanocorps prometteurs du SRAS-CoV-2 en donnant une petite dose de protéine COVID aux lamas (qui produisent des nanocorps en réponse, tout comme les humains produisent anticorps en réponse à un vaccin). Après avoir prélevé de petits échantillons de sang sur les lamas et séquencé l’ADN du nanocorps, les scientifiques ont ensuite transféré des gènes clés à des bactéries qui, à leur tour, produisent beaucoup moreover de nanocorps pour analyse en laboratoire.
Mais le criblage de ces bibliothèques de nanocorps pour voir dans quelle mesure elles fonctionnent (et contre quelles variantes elles fonctionnent) peut prendre du temps et coûter cher. Rout et ses collègues se sont longtemps appuyés sur la system de “spectrométrie de masse”, qui fonctionne extraordinairement bien mais nécessite une skills substantielle pour être performante et un équipement coûteux. Ils se sont demandé si une “méthode d’affichage de levure” récemment découverte, qui était potentiellement beaucoup moins coûteuse et furthermore very simple, pouvait également trier efficacement leur bibliothèque de nanocorps.
Rout, en collaboration avec Fred Cross de Rockefeller, a commencé par optimiser d’abord la méthode d’affichage de la levure. (Les deux cooks de laboratoire ont pris la décision inhabituelle d’effectuer eux-mêmes la plupart des travaux de paillasse). Ils ont ensuite utilisé leur méthode optimisée pour cribler une bibliothèque de nanocorps qu’ils avaient précédemment criblée avec la method de spectrométrie de masse. Ils ont découvert que leur variation de la méthode d’affichage de la levure identifiait non seulement bon nombre des mêmes nanocorps candidats que l’autre approche, mais identifiait également de nombreux autres candidats qu’ils avaient manqués.
“La méthode n’est pas la nôtre”, précise Cross. “Mais nous l’avons simplifié.”
Vers la thérapie par nanocorps
La procédure relativement uncomplicated et peu coûteuse décrite dans l’article pourrait permettre aux laboratoires des zones à faibles ressources de générer des nanocorps contre le SRAS-CoV-2, ainsi que d’autres virus. “Un chercheur n’importe où dans le monde, avec des ressources assez limitées, pourrait utiliser cette technique”, explique Rout. “Les trucs liés au lama pourraient être FedEx-ed d’Amérique du Nord.”
Pour COVID, l’objectif à extensive terme est que de telles methods abaissent la barre d’entrée dans la recherche sur les nanocorps et produisent finalement des thérapies qui préviennent l’infection. “La façon dont nous ferions la thérapeutique n’est pas encore établie”, déclare Cross. “La spécificité est là et l’activité est là, mais nous n’avons pas encore de médicament. Ce serait bien si nous en avions. Espérons qu’un jour.”
Parce qu’avec la transition de COVID vers une maladie endémique, de nouvelles méthodes de prévention de l’infection ne peuvent pas arriver assez tôt. “De nouvelles variantes deviennent répandues en éludant le système immunitaire”, explique Cross. “Il est crucial d’avoir un moyen rapide de trouver de nouveaux nanocorps ciblant les variantes.”